两栖动物线粒体基因组tRNA基因重复丢失及其-应用与环境生物学报.PDFVIP

2010 16 6 ): 822~827 2010-12-25 应用与环境生物学报 ， ( Chin J Appl Environ Biol=ISSN 1006-687X DOI: 10.3724/SP.J.1145.2010.00822 两栖动物线粒体基因组tRNA基因重复、丢失及其影响* 1, 2 1, 3 1** 1** 夏 云 彭 锐 郑渝池 曾晓茂 1 （中国科学院成都生物研究所 成都 610041） 2 ( 中国科学院研究生院 北京 100049) 3 ( 四川大学生命科学学院 成都 610064) 摘 要 在脊椎动物线粒体基因组中，偶有tRNA基因重复或丢失事件发生，这些事件因与相应氨基酸转运密切关联 而凸显重要. 两栖类中，这些重复或丢失相对多样，可为相关研究提供良好素材. 为了解这些事件对氨基酸对应的密 码子使用偏好是否产生影响，本文引入统计方法，检测 10种两栖类mtDNA蛋白编码基因相对的同义密码子使用度 （RSCU ）, 并特别设计将发生tRNA基因重复或丢失物种与其近缘群进行对比分析. 结果显示，tRNA基因的重复对密 码子使用偏好没有显著的影响，推测可能与突变积累的时限和mtDNA紧凑性有关. 另外，tRNA基因丢失也未使相应 氨基酸密码子使用偏好产生明显的改变. 推测在两栖类中，“tRNA转入”和“tRNA反密码子摆动位点的超级摆动”可 能是tRNA基因丢失的补偿方式 . 表3 参31 关键词 两栖类；线粒体基因组；密码子使用偏好；tRNA基因重复；tRNA基因丢失 CLC Q959.506 Influence of tRNA Gene Duplication and Loss within Amphibian Mitochondrial Genome* XIA Yu�1, 2, PENG Ru�1, 3, ZHENG Yu�h�1** ZENG X���m��1** 1 ( Chengdu Institute of Biology, Chinese Academy of Sciences, Che�gdu 610041, Ch���) 2 ( Graduate University of Chinese Academy of Sciences, Be�j��g 100049, Ch���) 3 (