大分子拥挤下核酸单链的结构性质.pdfVIP

第 卷 第 期 武汉大学学报（理学版） Ｖｏｌ．６０Ｎｏ．２ ６０ ２ 　 年 月 （ ） ， ２０１４ ４ Ｊ．ＷｕｈａｎＵｎｉｖ．Ｎａｔ．Ｓｃｉ．Ｅｄ． Ａ ｒ．２０１４０９５～１０１ 　 ｐ  文章编号： （ ） １６７１８８３６２０１４０２００９５０７ 大分子拥挤下核酸单链的结构性质 刘凯吉，王凤华，谭志杰 （武汉大学 物理科学与技术学院，湖北 武汉 ４３００７２） 摘 要：通过粗粒化模型构建核酸单链，采用ＭｏｎｔｅＣａｒｌｏ方法系统地研究了拥挤大分子体积比和尺寸对中性核 　　 　 酸单链结构性质的影响，得到了核酸单链端 端距离 与大分子体积比 和半径 的关系曲线 实验结果表明，大分  犚ｅｅ Φｃ 犚ｃ ． 子拥挤可导致核酸单链形成更加紧凑的结构，拥挤分子的体积分数越大、尺寸越小，核酸单链的结构越紧凑，而且大 分子拥挤对较长的核酸单链影响更大，并进一步通过分析拥挤大分子的分布，揭示了大分子拥挤效应产生的机制． 关 键 词：核酸单链； 模拟；拥挤大分子；结构塌缩；偶分布函数 ＭｏｎｔｅＣａｒｌｏ 　 　 中图分类号： 文献标识码： Ｏ４６９ Ａ 　　　 犛狋狉狌犮狋狌狉犲犘狉狅犲狉狋犻犲狊狅犳犛犻狀犾犲犛狋狉犪狀犱犲犱犖狌犮犾犲犻犮犃犮犻犱 狆 犵 狑犻狋犺犕犪犮狉狅犿狅犾犲犮狌犾犪狉犆狉狅狑犱犻狀犵  ， ， 犔犐犝犓犪犻犻犠犃犖犌犉犲狀犺狌犪 犜犃犖犣犺犻犻犲 犼 犵 犼 （ ， ， ， ， ） ＳｃｈｏｏｌｏｆＰｈｓｉｃｓａｎｄＴｅｃｈｎｏｌｏ ＷｕｈａｎＵｎｉｖｅｒｓｉｔ Ｗｕｈａｎ４３００７２ ＨｕｂｅｉＣｈｉｎａ ｙ ｇｙ ｙ ： ， 犃犫狊狋狉犪犮狋Ｎｕｃｌｅｉｃａｃｉｄ ｅｎｅｒａｌｌｒｅｓｉｄｅｓｉｎｃｅｌｌｕｌａｒｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｓｗｉｔｈｍａｃｒｏｍｏｌｅｃｕｌａｒｃｒｏｗｄｉｎ．Ｉｎｔｈｉｓｗｏｒｋ ｕ 　　 ｇ ｙ ｇ （ ）