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2012年qPCR原理与分析方法PPT
― qPCR系统;内容概要;实时定量PCR技术的概念;实时荧光定量PCR技术涉及的概念 ;扩增曲线图:
横坐标:扩增循环数(Cycle);纵坐标:荧光强度
每个循环进行一次荧光信号的收集;Ct值的定义:
PCR扩增过程中,扩增产物的荧光信号达到设定的阈值时所经过的扩增循环次数;横轴:PCR反映循环数;Ct值定量数学原理;Ct值定量数学原理;Ct值定量数学原理;Cycle number;;;非特异性荧光标记:
1.SYBR Green
特异性荧光标记:
2.TaqMan
3.Molecular Beacon;TaqMan---水解型杂交探针;TaqMan探针工作原理; 标记荧光的发夹探针
环与目标序列互补
茎由互补配对序列组成;SYBR Green 法反应示意图;; 几种方法的应用比较; 起始模板的测定
基因型的分析
融解曲线分析:可以优化PCR反应的条件,对常规 PCR有指导意义,如对primer的评价;可以区分单一引物、引物二聚体、变异产物、多种产物;Sample;将温度与荧光强度的变化求导。(-dI/dT);融解曲线分析,单一峰无非特异性荧光
定量准确;SYBR法实验流程及注意事项;样品制备;样品制备;RT;模板准备;反应体系优化;技能要求;数据分析;;绝对定量简介;绝对定量简介;扩增效率(E):扩增效率与标准曲线的斜率相关:E=10-1/斜率,理论的扩增效率理论值应该为2,即每 一个循环的PCR产物都翻倍,那么2=10-1/斜率,优化的标准曲线斜率应该为-3.32
E用每个循环扩增模板百分比表示即:E%=(E-1)×100%
例如E=1.95,那么E%=(1.95-1)×100%,即每次循环有95%模板被扩增
;绝对定量举例:HBV病毒检测;标准曲线制作举例;标准曲线制作举例;;分析方法: 2 - △Ct
2 - △△Ct
Pfaffi法;2-△Ct法应用举例:测定Jun基因在某因子作用前后的表达变化;2-△△Ct法应用举例:测定Jun基因在某因子作用前后的表达变化;Pfaffi法应用举例:测定Jun基因在某因子作用前后的表达变化;荧光定量常见问题分析
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