高性能云计算：从科学应用的角度high-performanceclo.doc

PAGE PAGE 1 2009年第10届普适系统、算法和网络国际研讨会 高性能云计算：从科学应用的角度 摘要：科学计算往往需要可用的数量庞大的计算机来执行大规模实验。传统上，这些需求已通过使用高性能计算机解决方案和安装集群和超级计算机等设施来解决，这些设施很难建立，维护和操作。云计算为科学家提供了利用计算基础设施的完全新模式。计算资源，存储资源，以及应用程序，可动态提供的（和现有的基础设施集成）基础上按使用量付费。他们不需要的时候，这些资源可以被释放。提供这种服务通常是在保证所需服务质量的服务水平协议范围内。Aneka，一个企业云计算解决方案，通过利用私有云和公有云的计算资源向用户提供所需的服务质量。其灵活性和基础设施服务支持多种编程模式，使Aneka适用各种不同的场景：从财务应用程序到科学计算。作为在云中进行的科学计算案例，提出了利用Aneka进行基因表达数据分类和脑功能磁共振成像工作流程执行的初步案例研究。 关键字：科学计算，计算科学，云计算，高性能计算 一、引言 科学计算包括数学模型和数值求解技术来解决科学，社会科学和工程问题。这些模型往往需要大量的计算资源进行大规模的实验，或计算复杂性削减到一个合理的时间框架。这些需求已初步具有专用高性能计算（HPC）的基础设施，如集群或同一部门联网的机器群，这些基础设施由“CPU周期清道夫”管理，如秃鹰软件。随着网格计算的到来，给