环境微生物学第一章微生物分类学.ppt

16S rDNA序列 内转录间隔区ITS（internal transcribed spacer ） 分离菌株 形态培养 分子鉴定 生理生化 分析结果 第三节 微生物分类方法和分类系统 一、常用的分类方法 经典分类法(classic taxonomy) 它的特点是随机的和不系统的根据少数几种特征进行分类。常用的特征主要是形态特征和生理生化特性。 科以上的分类以形态结构为主，科以下的以生理生化特性加形态为主。 数值分类法(numerical taxonomy) 根据较多的特征进行分类，一般为50-60个，多者可达100个以上，在分类中，每一个特性的地位是完全等同的。 通常是以生理生化特征，对环境的反应和忍受性以及生态特性为依据。最后，将所测菌株两两进行比较，并借用电子计算机计算出菌株间的总类似值。再结合主观上的判断(如划分类似程度大于85%者为同种；大于65%者为同属等)，排列出一个个分类群。 化学分类法(chemotaxonomy) 根据微生物细胞的特征性化学组分进行分类。 可分析细胞壁中的肽聚糖及其结构、多糖、胞壁酸等； 分析细胞膜化学组成、脂肪酸等； 分析蛋白质的氨基酸序列、血清学、电泳图谱等； 分析微生物的代谢产物等。 遗传分类法(genetic taxonomy) 遗传分类法的特点，主要是从遗传学角度估价微生物间的亲缘关系。以G+C含量和不同来源DN