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基因组学 （Genomics） 本课程性质 ?? 介绍基因组研究近况及意义 ?? 基因组研究的方法和策略 ?? 结合分子生物学和基因操作原理等 课程，学习开展课题研究的思路 主要参考书 《基因组》，Brown T A著，袁建刚等译，2002 《基因组学》，杨金水著，2002 《人类基因组－我们的DNA》，Dennis C等著， 林侠等译，2003 《人类基因组研究基本技术》，陈赛娟著，2002 近期发表相关文献 第１章　引言- 什么是基因组 1.1 基因组的概念 1.2 基因组计划 1.3 基因组计划对生命科学的影响和 意义 5 基因组（Genome）：指一个物种的全套染色体 和基因。 1.1 基因组的概念 广义的基因组： 核基 1.1 基因组的概念 基因组（Genome）：指一个物种的全套染色体 和基因。 广义的基因组： 核基因组（Nuclear genome） 线粒体基因组（Mitochondrion genome） 叶绿体基因组（Plastid genome）等 基因组学（Genomics）：研究基因组及其基因的科学。 最初是Thomas Roderick于1986年提出，其主 要内容是指基因组作图（Mapping）和测序 （Sequencing）。 21世纪从生物体整体上研究生命现象 研究整个物种基因组碱基的组成、基因的结构、 基因在染色体上的分布，基因的时空表达和调控 网络。 结构基因组学（Structural genomics）：它的最终目标除弄清基因组的全部序列，建立高精度的遗传、物理图谱和转录图谱还包括蛋白质的空间结构研究（Pandey Mann,2000） 后基因组时代(Post genomics era) 功能基因组学(Functional genomics) 转录组学(Transcriptomics) 代谢组学(Metanomics) 蛋白质组学(Proteomics) What is genomics? ? Genomics – Mapping, sequencing and analysis of genomes ? Structural genomics – High-throughput determination of 3D crystal structures ? Functional genomics – Simultaneous study of function of all genes in pathway or system ? Proteomics – Simultaneous study of all proteins in a pathway or system 1.2 基因组计划 Human Genome Project (HGP) On Feb 16th 2001… What happened? 2001年2月中旬，《Nature》与《Science》分别发表了 人类基因组工作框架图(the draft genome)，这是人类基因组计划(human genome project，HGP)实施以来所取得的最重大进展，也是生命科学领域中的一个里程碑。自HGP提出以来，到现在一共16年。这16年来科学家们所走过的是一条充满艰辛的路，同时也是一条谱写辉煌的路。回顾这段将在人类历史上永载史册的光辉历程，相信对每一位科学殿堂里的探索者都会大有启迪。我们应该记住他们，记住他们所作出的成就。 Human genome project Goal: characterize all human genetic material by determining the complete sequence of the DNA in the human genome. HGP is accomplished by the joint effort between U.S. Human Genome Project (HGP), composed of the DOE (Department of Energy )and NIH (National Institutes of Health), and Celera Genomics 相关故事 1984年12月9-13日，在美国犹他州盐湖城阿尔他，由美国能源部资助召开了一次环境诱变物和致癌物防护的国际会议，到会科学家提出了一个问题：有什么办法可以直接有效地检测出人类基因的突变？或者说有没有新方法可在日本广岛、长崎原子弹爆炸后的幸存者及其子女的群体中直接测定基因突变率的增加？因为在受辐射伤害的人群中，能检测到突变的比率与正常人相同，比预期低三分之二，这是生物科学家首次讨论人类基因组计划。 1985年5月，在加州大学圣达克鲁兹分校举行的一次非正式生物会议