7核酸结构预测.pdf

第七章 核酸结构分析 主要内容 • 第一节 核酸序列中的基因预测 • 第二节RNA二级结构预测 第一节核酸序列中的基因预测 • 人们获得各种核酸和蛋白质序列的目的是了解这个 序列在生物体中充当了怎样的功能角色。 • 多种角色: DNA序列中重复片段、编码区、启动子、 内含子/外显子、转录调控因子结合位点等信息； 蛋白质的分子量、等电点、二级结构、三级结构、 四级结构、膜蛋白的跨膜区段、酶的活性位点、以 及蛋白质之间相互作用等结构和功能信息。 • 虽然用实验的方法是多年以来解决这类问题的主 要途径，但新的思路是利用已有的对生物大分子 结构和功能特性的认识，用生物信息学的方法通 过计算机模拟和计算来“预测”出这些信息或提 供与之相关的辅助信息。 • 鉴于生物信息学的特点，可以用较低的成本和较 快的时间就能获得可靠的结果。 • 近10年来生物学序列信息的爆炸性增长大大 促进了各种序列分析和预测技术的发展，目 前已经可以用理论预测的方法获得大量的结 构和功能信息。 • 要注意的是，尽管各种预测方法都基于现有 的生物学数据和已有的生物学知识，但在不