生物信息学：第五讲BLAST序列比对.pptVIP

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2018-03-20 发布于河南
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生物信息学：第五讲BLAST序列比对.ppt

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生物信息学：第五讲BLAST序列比对

第五讲：BLAST 序列比对; 1. Basic Local Alignment Search Tool 2. Compare a query sequence to all the sequences in a specified database; BLAST的常用种类（详细见教材）： 1、blastn 2、blastp 3、tblastn 4、blastx 5、tblastx;例1：对给定的opsin蛋白进行blastp,目标数据库为nt,物种为Eukaryota;;;;;;;;;;;例2：对给定的olfactory receptor基因进行blastn,目标数据库为nt,物种为Eukaryota;;;;;;;;作业：对给定的2个基因(test1,test2)分别进行 blastn, blastp, tblastn, tblastx, blastx