第十讲__聚类分析(安徽农大徐建新版).pptVIP

第十讲 聚类分析CLUSTER ANALYSIS 第三节 相似系数的含义 第四节 系统聚类方法（Hierarchical Clustering Method） 一、系统聚类方法的基本思想 从一批样品的多个观测指标（变量）中，找出能度量样品间相似程度的统计 量，以这些统计量作为划分类型的依据，把一些相似程度较大的样品聚为一类， 另外一些彼此之间相似程度较大的样品聚合为另外一类，……。关系密切的聚合 到一个小的分类单位，关系疏远的聚合到一个大的分类单位，直到把所有的样品 都聚合完毕，把不同的类型一一划分出来，形成一个由小到大的分类系统，最后 再把整个分类系统画成一张分群图（又称谱系图），用它把所有样品间的亲疏关 系表示出来。 二、系统聚类方法的分析思路 先将每一个样品各自看成一类，然后定义样品间的距离（或相似系数）和类与 类间的距离。聚类过程是首先选择距离最小的两类将其合并成一新类（如果样品 间关系采用相似系数，则应选择相似系数绝对值最大的两类首先合并），再按类 间距离的定义，计算新类与其它类间的距离，再将距离最近两类合并，如此继 续，这样每次减少一类，直至所有样品都聚为一类为止。 三、系统聚类的方法 类与类间的距离有多种定义方法，例如可以定义两类间的距离为两类样品间的 最近距离，或者定义为两类样品间的最远距离等