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[临床医学]2012基因重组
重组DNA与基因工程 广州医学院实验医学研究中心 几个重要的专业名词 重组DNA技术(recombinant DNA technique),在体外通过末端共价连接重新组合脱氧核糖核酸(DNA)分子,使它们能在适当的细胞中增殖的遗传操作。 这种操作可把特定的基因组合到载体上,并使之在受体细胞中增殖和表达。 遗传工程(Genetic engineering )就是按人们的意思去改造生物的遗传特性、或创建具有新遗传物性的生物。 遗传工程广义包括细胞水平上的遗传操作(细胞工程)和分子水平上的操作,即重组DNA技术(有人称之为基因工程) 基因工程中最主要的工作是分子克隆(molecular cloning ) 重组DNA技术流程 一般包括四个步骤 ①产生DNA片段(目的基因的获得); ②DNA片段与载体DNA分子相连接; ③将重组DNA分子导入宿主细胞; ④选出含有所需要的重组体DNA分子的宿主细胞。 基因重组所必需的元素及过程 1 目的基因 2 载体 3 工具酶 4 宿主细胞 载体分类 按功能 ①克隆载体(目的基因拷贝 ); ②表达载体 (基因表达产物 ) 按宿主细胞 ①原核载体;②真核载体;③穿梭载体(携带两种宿主复制子,能在两种生物体内复制。) 常用的载体有质粒、噬菌体和病毒载体 ①质粒(plasmid)细菌细胞基因组外的共价闭合环状双链DNA分子,能自主复制,能与细菌共生的遗传成分。 ②噬菌体(phage)感染细菌的一类病毒,有的基因组较大,例如λ噬菌和T等;有的则较小,如M13、f1、fd等。 ③动物病毒(virus)质粒和噬菌体载体只能在细菌中繁殖,不能满足真核DNA重组需要。 ①比15kb小质粒比较容易分离纯化,>15kb的大质粒则不易提取。 ②能自主复制,只有ori能被宿主细胞复制蛋白质识别的质粒才能在该种细胞中复制 。 ③质粒对宿主生存并不是必需的 。 质粒载体的优缺点 ⑴优点——易操作,用途广 ⑵缺点——容量小,化学法的转化率低 ⒉噬菌体载体 双链DNA,滚环复制。 溶源性(温和phage )——感染细菌后,整和到细菌染色体 溶菌性(烈性phage )——感染后大量复制,细菌死亡破裂。 感染 溶源 条件诱导 溶菌 用作克隆载体的噬菌体 λ噬菌体和M13噬菌体 噬菌体载体的优缺点 ⑴优点——容量大,转染频率高,筛选方便 ⑵缺点——操作困难(需体外包装,CsCl2超速离心),保存困难(滴度下降) ⒊病毒载体 病毒载体构建时一般都把细菌质粒复制起始序列放置其中,使载体及其携带的外来序列能方便地在细菌中繁殖,然后再引入真核细胞。目前病毒载体常用的有改造来自猴肾病毒SV40(Simian Virus 40)、逆转录病毒和昆虫杆状病毒等,其目的为将目的基因或序列导入动物细胞中表达进行功能研究、或用作基因治疗等。 三、工具酶 一般分四类: ①核酸酶(切割和裂解) ②连接酶 ③聚合酶 ④修饰酶 1.核酸酶 核酸酶可分为两类: 核酸外切酶(exonuclease)是从核酸的一端开始,一个接一个把核苷酸水解下来; 核酸内切酶(endonuclease)则从核酸链中间水解3’,5’磷酸二酯键,将核酸链切断。 分类: 按限制酶的组成、与修饰酶活性关系,切断核酸的情况不同,分为三类: Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ Ⅰ类限制性核酸内切酶 由3种不同亚基构成,兼有修饰酶活性,随机切割在识别位点1000bp以外的DNA序列。 Ⅱ类限制性核酸内切酶 只由一条肽链构成,切割DNA特异性最强,在识别位点范围内切断DNA。通常在重组DNA技术使用的限制性核酸内切酶 Ⅱ型酶的特点 识别序列特异 ; 切割方式特异 ⑴识别序列 4-6碱基对,识别序列往往是旋转对称,迴文结构的双链DNA 5’…G↓AATT C …3’ 3’…C TTAA↑G… 5’ ⑵切割方式 平末端和粘末端 ⑶同裂酶 识别位点相同,切割位点不同或相同 ⑷同尾酶 来源不同,识别序列不同,但产生的粘性末端相同 星活性(star activity) ——非最适条件下酶的识别特异性降低,产生非特异的切割现象。 引起Star活性的原因 1. 较高的甘油浓度 (5% v/v)。 2. 酶与底物DNA比例过高 (不同的酶情况不同,通常为100
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