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Vorpal 培训（1） 运行和基本概念 基本概念 •Vorpal 面对的主要问题 •Vorpal模拟的基本过程 •需要准备的输入文件 •Vorpal中集成的浏览工具 •输出文件和后处理 主要问题 •Vorpal的核心部分来源于激光等离子体相 互作用，具体说，最初的应用是激光尾场 加速。 •在尾场加速方面，vorpal支持非常高路数 的并行（10,000 processes checked) 尾场加速 高功率微波 •近年来，vorpal发展了高功率微波器件和 加速器设备的建模，特别是支持三维复杂 形体。 加速器建模 •2009年之后，被发展用于加速器的束流控 制部分的优化设计 放电设备的建模 •Tech-X接收了oopic程序的商业化，并且将 oopic核心部分扩展融合进入vorpal中，用 于研究各种放电设备。 其他 •THZ设备设计，Hall发动机研究等，都是近 期vorpal的新应用。 讲座内容 •共五个部分： −基础用法和前后处理 −一个lwfa的模拟案例 − 电磁场的建模及功能细节 −等离子体粒子的建模和细节 −高级技术，包括不规则形体以及碰撞问题 Vorpal模拟的基本过程 •主程序 •输入文件和预处理 • 串行和并行运行 • 中间数据记录文件 •断点运行 Vorpal主程序 •Vorpal主程序是$vorpal/bin下的 vorpalser或者vorpal文件 •在图形界面下，可以使用vorpalstudio •Vorpal 程序读取执行目录下的输入文件， 建立模拟过程并执行，输出结果放在当前 目录下 输入文件 • Vorpal的模拟模型完全是由输入文件定义的 • Vorpal中的输入文件有两种风格：原生风格(.in) 文件和预处理风格(.pre)文件。 • .pre文件需要用python转化为.in文件后才能被 vorpal读入，因此vpstudio在运行的时候会自动 调用python转换程序 • 如果手工启动.pre文件，就需要在命令行将其翻 译为.in文件 预处理 • 预处理的基本格式： − python %VORPAL_INSTALL_DIR%\txutils\txpp.py --import=%VORPAL_INSTALL_DIR%\macros -- prefile=inputFile.pre --outfile=inputFile.in 这个命令将inputFile.pre处理并且输出到 inputFile.in • -import子句用于描述python的macro文件所在目 录 集成环境中的语法校订 •Vorpalstudio环境会自动校验.pre程序的 语法，提供一定的帮助。 执行 • 产生了.in文件后，就可以执行模拟 • 串行执行： − $vorpal/bin/vorpalser –i inputfile.in • 并行执行 − Mpirun –np nnn $vorpal/bin/vorpal –i inputfile.in • 可以设置一些开关用于控制模拟，但更好的方法 是在.pre或者.in文件中设置。 集成浏览器 • 依赖于.in文件中的设置，vorpal每执行若干个 时间步都会存储中间数据。 • 存储开始后，就可以利用集成的vorpalview程序 来快速浏览模拟结果 • 在vorpalview中，可以观察各种场和粒子的分布 输出文件 •vorpal的输出文件用hdf5格式 •如果vorpalview功能或者性能达不到要求， 你可以使用任何能读取hdf5文件的软件读 入或者用hdf5包将其直接转换为plain text •可以用hdfview或者matlab、IDL 转换工具 • H5dump程序可以将hdf5直接转换成txt文件 • Windows下面可以用hdfview • 也可以使用matlab的读取工具 • hinfo=hdf5info(lwfa_electrons_8.h5) • electrons=hdf5read(lwfa_electrons_8.h5,