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真核生物基因
表达调控;内容提要;真核生物基因调控可分为两大类;调控水平;基因调控的3个问题;8.1 真核生物的基因结构与转录活性;不同:
⑴ 真核生物染色质结构对基因表达调控作用非常明显
⑵ 有多个调控序列,必须有多个激活物同时特异结合才能调节基因转录
⑶ 转录与翻译分开
⑷ 具有细胞特异性或组织特异性表达;8.1.1 基因家族;1、简单多基因家族;2、复杂多基因家族;3、发育调控的复杂多基因家族;8.1.2 真核基因的断裂结构;8.1.3 DNA 染色体水平的调控;1、染色质的结构;活性染色质的主要特点;超敏感位点(hypersensitive site):当用极低浓度的DNaseⅠ处理染色质时,切割首先发生在少数特异位点,其敏感性超出其他区域100倍以上,称为超敏感位点。
具有组织特异性,一般每个活跃表达的基因都有一个或几个超敏感位点
多位于5’端启动子区域,少数位于转录单位下游,为RNA聚合酶、转录因子或其他调节蛋白提供结合位点。;核基质与基因活化;“灯刷型”染色体只有在两栖动物卵细胞发生减数分裂是才能被观察到,它是染色体充分伸展时的一种形态。;2、基因扩增;3、基因重排与变换;;交配型的转换(switch);研究酵母染色体上交配型基因位点时发现,每个单倍体酵母细胞都分别带有MATa或MATα,在这个基因位点两侧分别存在两个MAT样基因,HMLα和HMRα,在它们的上游调控区有“沉默子”阻遏基因表达,一般情况下不表达,它们又称为“沉默交配型盒”,机制为“暗箱模型”。;组蛋白的修饰;;;8.1.4 DNA甲基化与基因活性的调控;DNA甲基化与转录抑制;;;DNA甲基化抑制基因的转录;;;DNA甲基化与X染色体失活;Inactivation of X-linked genes in female Mammals;莱昂假说:;1、无汗性外胚层发育不良
2、三色猫;;8.2 转录水平的调节控制;转录水平的调节控制;转录调控的顺式作用元件;1. 启动子;;;元件名称
;增强子;SV40的转录单元上发现,转录起始位点上游约200 bp处有两段长72 bp的正向重复序列。;增强子的作用特点;沉默子 / 静止子(silencer);绝缘子(insulator);8.2.3 反式作用因子( trans acting factors );反式作用因子( trans acting factors );转录调节因子分类:;;转录调节因子结构;1. DNA识别或结合域;螺旋-转折-螺旋(HTH);锌指结构(zinc finger);;碱性-亮氨酸拉链;碱性-亮氨酸拉链;;碱性-螺旋-环-螺旋(HLH);;同源域蛋白(HomeoDomain);调控蛋白对特异DNA序列的识别;;转录活化结构域;;;Figure 17-19: Ways in which eukaryotic repressor work;Competes for the activator binding;某些抑制蛋白能直接作用于通用转录因子或RNA聚合酶Ⅱ,干扰聚合酶的全酶的组装。
有些阻遏物可竞争激活蛋白结合位点。如海胆的组蛋白H2B基因仅在精子育生过程中才能表达,其启动子有两个CAAT框,与之对应的结合因子也广泛分布于各种组织中;然而胚胎组织中有CAAT置换蛋白与其竞争CAAT位点,从而阻断了该因子对靶序列的识别。;8.3 蛋白质磷酸化对基因转录的调控;受体分子活化细胞功能的途径;;细胞表面的三类主要受体;真核细胞主要跨膜信号转导途径;蛋白激酶;8.3.1 受cAMP水平调控的A激酶;cAMP活化糖原磷酸化酶;转录因子被激活;8.3.2 C激酶与PIP2、IP3和DAG;IP3引起细胞质Ca2+浓度升高,使C激酶从胞质转运到质膜内侧,并被DAG和Ca2+所激活;8.3.3 CaM激酶及MAP激酶;级联磷酸化;8.3.5 蛋白质磷酸化与细胞分裂调控;细胞周期与调节;8.4 蛋白质的乙酰化;具有组蛋白乙酰基转移酶活性蛋白参与转录调控;8.4.2 组蛋白乙酰化及去乙酰化对基因表达的影响;转录起始和加工的调控;两种酶结构相似
胞外酶仅多了信号序列,经切除后胞外酶比胞内酶在N端仅多了一个Ser
经分析发现Suc-2基因有3个TATA框,但尚不清楚与2种酶的关系,也没有确定是否存在cAMP-CAP位点;二、选择性加工;翻译水平的调控;(A激酶PKA);真核生物基因
表达调控
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