分子诊断学_绪论感染性疾病的分子诊断
巨细胞病毒(cytomegalovirus virus, CMV) Section 3 病原菌的基因检测 结合分歧杆菌的基因检测 结核分歧杆菌MTb,俗称结核杆菌TB,是结核病的致病菌。带病菌的痰液是TB主要的传染源。 MTbH37Rv基因组结构:环状双链DNA,共4 411 529kb,富含重复序列尤其是插入序列、多基因的家族序列及重复的管家基因序列。 TB分子诊断方法1 临床标本处理: 标本:痰、胸腹腔积液、血清、尿液、脑脊液 处理:液化剂去除粘蛋白,若带血则用红细胞裂解液去除血红蛋白,提取DNA TB分子诊断方法2 常用的是靶分子扩增方法:直接PCR法、SDA法、LCR法 扩增片段:抗原蛋白编码基因-165bp、MBP64-240bp、IS6 110-123bp、IS986-245bp、16S DNA-584bp TB的种属鉴定:以16S rRNA为靶基因 美国FDA:Amplicor检测和MTD检测 TB分子诊断方法3 耐药性检测 耐药性分子基础: 利福平是抗结核治疗的关键药物。耐药的分子基础是RNA聚合酶的突变,主要集中在rpoB基因的81bp区域。 耐药性鉴定: PCR-SSCP法和点突变的检测法 金黄色葡萄球菌 幽门螺杆菌 O157型大肠埃希菌 淋病奈瑟菌 标本的预处理 核酸的提取(DNA提取、 RNA提取) 扩增抑制物的去除 危险病原体的灭活 四、感染性
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