基因组的结构与功能技术 培训.ppt

基因组的结构与功能;概念;Genome data for plant and animal species;概念;二 病毒基因组结构与功能的特点;;;三 典型病毒基因组介绍;1.SV40病毒基因组; Early genes: expressed prior to the onset of viral DNA replication;DNA Virus Transcriptional Cascad;SV40 Genome: Circular dsDNA;From Flint et al. Principles of Virology (2000), ASM Press;A;2.乙型肝炎病毒基因组;乙型肝炎病毒基因组结构和功能;乙型肝炎病毒基因组结构和功能;HBV基因组的结构和转录图谱;Hepadnaviruses and Caulimoviruses: DNA Genomes Reverse Transcribed from a +RNA Template;Hepadnavirus Replication;3.脊髓灰质炎病毒基因组;3.脊髓灰质炎病毒基因组;4.逆转录病毒(retroviruses);癌基因;;非编码区;(2)前病毒基因组的转录和翻译;(3)人类免疫缺陷病毒基因组;;;HIV;第二节 原核生物基因组;一 原核生物基因组结构和功能的特点;一 原核生物基因组结构和功能的特点;二 质粒(plasmid);质粒的遗传控制;质粒的遗传控制;质粒的类型;三 转位因子(transposable element);(一)转位因子的类型及特征;转座子(Transposon, Tn) 一类较大的转座成分,至少带有一个与转座作用无关并决定宿主菌遗传性状的基因。含转座酶 复合型Tn:由一个基因序列及两侧臂(IS序列或类IS序列)构成 TnA族Tn:两端有重复序列,中间有与Tn功能相关的基因及抗生素抗性基因 接合型Tn:G+菌中存在的一类可以在不同细菌间通过接合进行转移的Tn; ;(二)转位作用的机制;2.复制性转座(有内解离区或res位点);转座作用机制;四 原核生物基因组研究及意义;;第三节 真核生物基因组;一 真核生物基因组结构与功能特点;一 真核生物基因组结构与功能特点;二 真核生物基因组的结构;Origin of CpG (CG) islands;Origin of CpG (CG) islands;By contrast, the CG sequences in inactive genes are usually methylated to suppress their expression.? The methylated C may be converted to T by accidental deamination.? Unlike the C to U mutation which is efficiently repaired, the C to T mutation can be corrected only by the mismatch repair which is very inefficient.? Hence, over evolutionary time scales, the methylated CG sequence will be converted to the TG sequence.? This explains the deficiency of the CG sequence in inactive genes. ;Inheritance of the DNA methylation pattern;Inheritance of the DNA methylation pattern. ;(二)顺式调控元件;顺式调控元???;顺式调控元件;Gene Structure ;;;;;;;(三)基因家族(gene family);基因家族类型;基因家族类型;(四)重复序列(repeat sequence);重复序列类型;(五)转座子;Human transposable elements;(六)端粒(telomere);端粒酶(telomerase);;;;;;;三 人类基因组的组织结构特点;(一)人类基因组的重复序列;(一)人类基因组的重复序列;小卫星DNA;微卫星DNA;(一)人类基因组的重复序列;Repeat content of the human genome;Repeat content of the human genome;Classes of transposable elements;Number of copies and fraction of geno