生物信息学什么是生物信息学-山东大学课程中心.PDF

生物信息学 第一讲：什么是生物信息学 2013.2.26 什么是生物信息学 生物信息学的产生和发展 生物信息学产生的背景： • 1866年，奥地利人孟德尔根据实验结果提出了基因是以实物存在的假说； 生物信息学的产生和发展 生物信息学产生的背景： • 1871年，瑞士人Miescher从白细胞细胞核中分离出脱氧核糖核酸 （DNA）； 生物信息学的产生和发展 生物信息学产生的背景： • 1944年，美国人阿弗莱、麦克李沃和麦克卡三人通过实验证明DNA是 生物的遗传物质； 生物信息学的产生和发展 生物信息学产生的背景： • 1944年，美国人Chargaff发现DNA中鸟嘌呤（G）与胞嘧啶（C ）数量 相等，腺嘌呤（A ）与胸腺嘧啶（T ）数量相等； 生物信息学的产生和发展 生物信息学产生的背景： • 1953年，英国人Watson和Crick在Nature杂志上发表了DNA的双螺旋 结构模型； 生物信息学的产生和发展 生物信息学产生的背景： • 1962年，Watson ，Crick和Wilkins 因发现了DNA的双螺旋三维结构共 同获得了诺贝尔生理学医学奖。 Watson Crick Wilkins Franklin 生物信息学的产生和发展 生物信息学产生的背景： • 1954年，Crick提出了中心法则“DNA - RNA - 蛋白质”； 生物信息学的产生和发展 生物信息学产生的背景： • 1966年，美国人Nirenberg和Khorana破译了全部遗传密码字典的64个 密码子。 生物信息学的产生和发展 生物信息学的萌生： • 1956年，美国田纳西州的盖特林堡召开了“生物学中信息理论研讨会”； • 1979年，美国洛斯阿拉莫斯实验室建立了GenBank数据库； • 1982年，欧洲分子生物学实验室（EMBL）建立了核酸序列数据库； • 1984年，日本建立了核酸序列数据库DDBJ； • 90年代初，三大核酸数据库开始资源共享，联合成立了国际核苷酸序 列数据库； • 1987年，美国学者林华安首创了“bioinformatics”一词，“compbio” - “bioinformatique” - “bio-informatics”； 生物信息学的产生和发展 人类基因组计划： • 1990年，国际人类基因组计划启动，预算30亿美元，被誉为生命科学“阿 波罗登月计划”，参与国：美、英、日、德、法； • 1997年，在耗费了巨额资金和一半预定时间之后，仅完成了3%的工作； • 1998年，Craig Venter创立Celera公司； • 1999年，Celera公司在无政府资助下，赶超了多国合作小组； • 1999年，中国加入多国合作小组，负责测定基因组全部序列的1％； • 2000年，在美国总统克林顿的协调下，Celera公司与多国合作小组合 作，宣布完成了人类基因组草图的90 ％； • 2001年，完成了人类基因组草图的99 ％，Celera公司与多国合作小组合 作几乎同时分别在Science和Nature上独立发表自己的草图； • 2003年，人类基因组序列图绘制成功，彻底完成。 生物信息学的定义 美国国家基因研究中心：生物信息学是一个代表生物学、数学和计算机 科学的综合力量的新兴学科。 美国乔治亚理工大学：生物信息学是采用数学、统计学和计算机等方法 分析生物学、生物化学和生物物理学数据的一门综合性学科。 美国密苏里大学：生物信息学是获知、管理和处理生物信息的科学与技 术。 美国加州大学洛杉矶分校：生物信息学是对生物信息和生物学系统内在 结构的研究，它将大量系统的生物学数据与数学和计算机科学的分析理 论及使用工具联系起来。 中国军事医学科学院欧阳曙光：生物信息学是研究生物信息的采集、处 理、储存、传布、分析和揭示的科学，它通过综合数学、计算机科学与 工程学、生物