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采购需求 北京政府采购中心
附件1: 技术需求
一、项目背景
满足我院临床实验与临床研究中心(CTRC)临床研究的临床诊疗信息、组学数据(全基因组、外显子、RNA、蛋白质组数据)及高分辨影像数据的存储、处理和运算的需求(约1万人/年);
满足我院神经系统单基因病诊断中心每年三千例单基因病患者致病突变和药物代谢基因DNA检测数据的处理和分析需求;
满足国家神经系统疾病临床医学研究中心对大规模多模态医学影像数据进行数据分析的需求,建立基于医学数据的智能辅助诊断系统,满足相关的深度学习算法开发、平台搭建以及应用的需求;
满足我院未来开展全国性或地区性项目所需的数据收集、上传、共享、管理等需求。
二、项目内容
提供高性能运算集群总体解决方案,以集成后的运算集群和系统为产品形式进行验收。高性能运算集群的总体解决方案,包括但不限于以下内容:
提供构建高性能运算集群所需的服务器、存储、网络连接、信息安全等硬件设备;
提供高性能运算集群所需的集群管理、作业调度等软件,以及软件的安装调试服务;
提供相应的系统集成、维保服务等,并结合使用方的需求,对集群设置进行动态调整和优化。
配合使用方,提供机柜、制冷等基础设施的配置、安装等方案。
本项目须遵循以下设计原则:
高性能计算平台应具有处理大规模的复杂运算,尤其是浮点运算的能力。它将为首都医科大学附属北京天坛医院提供优化设计、分析、验证的手段,最终实现提高科研质量、缩短科研周期、降低科研成本。因此,方案设计以用户现场测试结果为基础,根据用户对未来应用模式及业务量需求预测为前提,强调高性能以及可行、合理和低风险。
先进性
本系统方案所采用的技术既要符合业界的发展方向,又要在未来几年内仍具有很高的技术先进性,保持在同类系统中的领先地位。不仅具有符合要求的峰值性能(Peak Performance),更重要的是应具有稳定的应用性能(sustained performance)。各种复杂的研究课题在本系统中能够得到准确、快速的计算结果。
可扩展性
高性能计算平台应具有较强的扩展能力,可以方便地实现节点增加、系统扩充和升级。计算节点的扩展不受硬件品牌限制。开放性和兼容性
系统应符合公认的工业标准,包括体系结构,硬件,I/O,网络,操作系统,开发环境和开发工具等。便于和其他平台上的系统。
应用软件开发
能够研究课题的解决方案和相应的软件系统例如提供并行计算应用。管理简单,用户易用
尽量减少数据中心的设备管理难度,简化架构,底层硬件对用户透明,实现应用简单易用的目的。
设备名称:生物信息分析与基因检测系统高性能运算集群。
数量:1套
各分项指标如下:
序号 产品名称 功能要求 数量 单位 备注 3.1生物信息分析计算系统 1 通用序列比对分析计算节点 双路节点,运行bwa、clustal等生物信息学软件。详细要求见技术参数4.2.1 80 台 核心产品 2 通用节点刀片平台 满足通用序列比对分析计算节点所需的配套刀片平台。详细要求见技术参数4.2.2 8 台 3 高主频序列比对分析计算节点 双路节点,运行tophat、hisat2等生物信息学软件。详细要求见技术参数4.2.3 80 台 4 高主频节点刀片平台 满足高主频序列比对分析计算节点所需的配套刀片平台。详细要求见技术参数4.2.4 8 台 5 序列拼接大内存计算节点 四路和八路节点,运行大内存生物信息软件详细要求见技术参数4.2.5 4 台 核心产品 6 系统管理登录节点 双路节点,系统管理和登录。详细要求见技术参数4.2.6 4 台 3.2测序数据存储 1 测序数据存储 与测序仪进行连接。详细要求见技术参数4.2.7 4 台 3.3主体在线分布式并行存储系统 1 并行存储数据节点-86盘位 在线数据存储。详细要求见技术参数4.2.8/9 16 套
核心产品 2 缓存盘 详细要求见技术参数4.2.8/10 128 块 3 数据存储 详细要求见技术参数4.2.8/11 1280 块 4 并行存储索引节点 详细要求见技术参数4.2.8/12 4 套 3.4磁带库备份存储系统 1 备份服务器 详细要求见技术参数4.2.13 2 台 2 FC交换机 详细要求见技术参数4.2.14 1 台 3 磁盘阵列 详细要求见技术参数4.2.15 1 套 4 备份软件 详细要求见技术参数4.2.16 1 套 5 磁带库主机 详细要求见技术参数4.2.17 1 套 6 磁带 详细要求见技术参数4.2.18 1500 块 7 清洗带 详细要求见技术参数4.2.19 30 块 3.5系统网络与安全系统 1 计算存储网络-IB交换机 详细要求见技术参数4.2.20 1 套 可为进口产品 2 计算存储
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