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中国浪潮天梭高性能服务器助推沙特生物技术产业发展.pdf

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中国浪潮天梭高性能服务器助推沙特生物技术产业发展

中国浪潮天梭高性能服务器助推沙特生物技术产业发展 浪潮集团沙特总经理 李志强 “椰枣树是天堂里的植物,阿拉伯人的母亲”,“6个椰枣管一天”。——对于生活在沙漠中的阿拉伯民族 来说,易于保存、营养丰富的椰枣是他们赖以生存的重要食物和经济作物之一。据了解,沙特阿拉伯王国 的椰枣产量占全世界产量的15%——就像中国人离不开稻米一样,椰枣也是沙特王国重要的生命线。 如何让沐浴着古老文明的椰枣林焕发更美好的青春?2007 年,沙特王国阿卜杜拉阿齐兹国王科技城 (KACST)宣布正式启动椰枣基因组计划(DPGP)。沙特希望通过完成椰枣基因组计划,建立一个较有 影响的生命科学与生物技术中心,通过分析椰枣基因组实现防控病虫害,改良椰枣品质,提高产量,进而 拉动沙特相关生物技术产业发展。 不过,这样庞大的生命工程,单凭一己之力难以完成,沙特迫切需要一个强大的帮手共同介入该基 因组研究计划中去。在走访了多个国家的基因组研究中心后,沙特最终将合作伙伴锁定在中国。 科技联姻,聚焦沙特生命线 2008 年 11 月,一个集结了中、沙两国科研实力的生命科学与生物技术中心宣告成立,中沙双方预 计在3 年内完成中沙两国椰枣基因组全部研究工作,并向全球发布椰枣基因组序列图。 该项目不仅是沙特政府资助的最大的生命科学领域科研项目,也是中国生命科学领域科学家参与的 由国外政府资助的最大规模的国际科学研究计划,对于该项目中沙双方均投入了空前的关注。 沙特王国KACST 特别任命该国King Faisal 大学农业与食品学院的权威椰枣遗传学家Ibrahim S. Al-Mssallem 教授为首席科学家,并斥资2000 多万美元启动“椰枣基因组计划”。与此同时,中国科研人 员也紧锣密鼓地进行科学规划、主要技术支撑和人员培训等各项工作,并于2008 年 11 月派出由11 名科 研人员组成的首批专家队伍,奔赴沙特利雅得市正式展开工作。 沙特国王、内阁大臣对该计划非常重视,曾多次致电胡锦涛主席。胡锦涛主席也特别提出:“ 中国政 府和沙特政府都十分重视科技事业发展,也高度重视中沙科技合作。椰枣基因组计划非常重要,是一个重 大的科研合作项目,因为椰枣具有重要的经济价值。这个项目不仅具有深远的科学意义,对两国的科学发 展很重要,对于两国政府和人民的友谊也非常重要。 胡锦涛主席前往KACST 考察项目进展情况合影 横亘眼前的应用屏障 使命是神圣而光荣的,然而生命科学对高性能计算的需求是空前巨大的,摆在两国科研工作者面前 的是一道巨大的屏障——作为生命科学的一个重要研究领域,基因研究工程需要的计算机资源(包括计算速 度、内存和磁盘存容量以及网络通信能力) 将超过人类登月工程上百万倍。如果只是利用单台的PC 或者 SERVER 必定无法满足科研工作的需要——这要求一个完美的基因数据处理平台,来解决整个计算系统中 对计算能力以及存储能力的需求。 不过,沙特显然对此并不满足,考虑到未来项目开展后的实际需求,他们更希望一劳永逸。随着基 因数据量的增加,用来进行序列对比或者进行同源分析所耗费的时间会越来越多,对计算量和存储量的需 求越来越大,因此系统一定要有很强的扩展能力,以满足日后的需要;另外,有些应用可能要运行几天甚 至几个月,那么功耗问题也是不得不考虑的了。 更重要的是,从事椰枣基因组研究科研工作者往往是某一方面的专家,大多对计算集群并不是十分 的了解,因此沙特还希望这个平台系统可以实现“傻瓜操作”——这就要求系统一定要尽可能的易于使用与 管理,便于使科研工作者将更多的时间和精力投入到科研工作中去。 “定制方案+全程服务”模式 延续生命之源 作为中沙椰枣基因组计划生物信息平台承建单位,浪潮 ()深刻感觉到历史使命 感和高度荣誉感。针对中沙椰枣基因组计划生物信息平台项目需求,同时结合多年来对科学计算领域高性 能应用的深刻理解,浪潮特别推出了全套的解决方案,以“定制方案+全程服务”的组合拳模式,有效解决 了计算量和实际应用两类难题。 针对本次项目需求,浪潮特别提供了基于业界最先进的32 纳米英特尔®至强™5600 系列处理器的 浪潮天梭TS10000 集群。该集群具有计算性能优越、功耗控制领先、监控管理系统方便易用、系统开放 易于扩展、服务体系完善等特点。天梭TS10000 采用由72 个计算节点,CPU 总数达到了144 颗,576 核心参

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