基因甲基化给研究分析生讲课课件2.ppt

胞嘧啶3.36 min; 5-甲基胞嘧啶4.33 min;腺嘌呤7.06min;鸟嘌呤8.43 min;胸腺嘧啶13.98 min * * 表观遗传学 从根本上讲，表观遗传是环境因素和细胞内的遗传物质之间发生交互作用的结果。 与中心法则不同，表观遗传学认为遗传信息并非单方向传递，环境因素也能改变遗传物质。 目前表观遗传学研究主要集中在甲基化、组蛋白修饰、小RNA 和 染色质重塑等方面。 骡和駃騠 前者又称马骡，是公驴与母马杂交的后代，体大、耳小而尾部蓬松; 后者又叫驴骡，是公马与母驴杂交的后代，相对来说体小、耳大而尾毛较少。这个现象表明，来源于不同性别亲本的遗传物质在后代表达的功能可以有差别。这就是基因印记。 基因印记 Hinny 駃騠 Mule 类胰岛素生长因子-2 基因Igf2( 位于7 号染色体) 在小鼠身体里是否表达，要看它是否是受之于父亲，因为来自母亲的基因拷贝是处于失活性状态的。这就是说，该基因是被母亲所印记的。 相反，17 号染色体上的Igf2r是被父亲所印记的，被特别关注。因为来自父亲的Igf2r是处于失活性状态的，它只有受之于母亲才在体内表达。 类胰岛素生长因子 亲代印记的结果是，被印记的基因所表现的形式好像半合子的情况，尽管在每一个细胞中这种体细胞基因均成对存在。 分子水平的分析发现，DNA 序列并没有发生改变。那么，功能与性状的变化因何而起? X染色体失活 X 连锁的O基因控制黄色毛性状，其等位基因o控制黑色毛性状，另有常染色体基因S 控制白色性状。在杂合子猫XOXo，一些细胞团产生黄毛 、一些细胞团产生黑毛，在白色背景下构成3 色皮毛。 现象与猜想—— 基因一定受到了某种修饰，这种修饰效应能够通过有丝分裂和减数分裂实现代间传递。 甲基化的发现—— 1979 年 Mc Ghee 等发现与鸡β珠蛋白基因比邻的胞嘧啶核苷酸甲基化后，该基因转录受抑制的现象。 胞嘧啶的 嘧啶环上 第5位碳原子加上一个甲基 IPA LTR LTR Phenotype diversity contributed by dynamics of epigenotype WT IPA LTR LTR Agouti 别小看一个小小的修饰，却给DNA增加了额外的信息，使得有限的基因组遗传信息的表现呈现出丰富的多样性和可塑性。 简单地把DNA甲基化理解为“一把锁”，凡是被DNA甲基化标记的部分，大都是需要被“尘封”“监禁”的基因，比如基因组的“捣蛋鬼”—转座子，就是被甲基化这把“锁”管制着，失去管制或管制不严，这些“捣蛋鬼”会在基因组里跳来跳去，把基因组搞得一团糟，会引起很多问题，如肿瘤、精神疾病等。 酵母与果蝇基因组中未能检测到任何甲基化CpG，这两种生物并不依赖DNA甲基化的方式来控制基因活性，它们采用其它的机制来达到同一目的。 脊椎动物与高等植物普遍利用DNA甲基化作为重要的调控机制。 DNA甲基化是常见的表观遗传学现象，它是指在DNA甲基转移酶(DNMTs)的作用下，将甲基添加在DNA分子中的碱基上。 DNA甲基化的主要形式: 5-甲基胞嘧啶,N6-甲基腺嘌呤和7-甲基鸟嘌呤 。 哺乳动物基因组中约有5％一1O％ 是CpG位点，其中约有70％ 为mCpG。 CpG岛 CpG岛主要位于基因的启动子区，少量位于基因的第一个外显子区；其甲基化状态直接影响基因表达。 甲基化的 CpG 双核苷酸通过募集转录抑制因子或者阻碍转录激活因子的结合抑制基因的表达。 CpG岛一般是非甲基化的，而在失活 X染色体、印记基因和非表达的组织特异基因中则是甲基化的。 成体基因组通常中，奢侈基因呈现高密度甲基化，而含有丰富 CpG 岛的管家基因则呈非甲基化。 CpG CpG表示核苷酸对，其中G在DNA链中紧随C后。 基因组中60%～90% 的CpG 都被甲基化, 未甲基化的CpG 成簇地组成CpG 岛, 位于结构基因启动子的核心序列和转录起始点。 基因组甲基化的特点： 可逆性——许多甲基化位点可以根据细胞活性的要求重新甲基化或去甲基化； 组织特异性——不同的组织细胞具有不同的甲基化模式，为基因表达设定程序。 异常的甲基化可分为高甲基化和低甲基化 ，前者指正常组织中不发生甲基化的位点被甲基化 ，后者是指在正常组织中发生甲基化的位点去甲基化。 突变热点：5-mC 胞嘧啶发生脱氨基作用,就可能被氧化成为U,被DNA修复系统所识别和切除,恢复成C.已经甲基化的胞嘧啶发生脱氨基作用, 它就变为T, 无法被区分. 可能导致基因置换突变, 发生碱基错配: T-G, 如果在细胞分裂过程中不被纠正,就会诱发遗传病或癌症。 DNA甲基化的相关蛋白 从头甲基化酶 Dnmt3a 在未分化的胚胎