生物化学教材---蛋白质.pptVIP

第二章 蛋白质的结构与功能;了解蛋白质的元素组成；掌握蛋白质的基本结构单位—氨基酸的基本结构；了解氨基酸的分类；了解稀有氨基酸和非蛋白质氨基酸；掌握氨基酸的各种理化性质；掌握肽键、肽链和蛋白质一级结构的概念，同时了解蛋白质一级结构的表示方法；掌握二肽及多肽的形成过程；了解蛋白质一级结构的测定方法。 。; 思考题;一、概述;（一）蛋白质的生物学意义和元素组成;2. 蛋白质的元素组成;（二）蛋白质的分类 ;1. 按蛋白质的构象分类;催化蛋白（酶） 调节蛋白 结构蛋白 运输蛋白 贮藏蛋白 运动蛋白 防御蛋白 电子传递蛋白;3.按蛋白质的组成和溶解性分类;二、蛋白质的基本组成单位–氨基酸 ;（一） 氨基酸的结构;脯氨酸;（二）氨基酸的分类;;;;2. 非编码氨基酸;3.非蛋白质氨基酸 ; 1.氨基酸的两性解离及等电点 氨基酸是两性电解质（ampholyte）;氨基酸两性解离;R;　;　; （1）氨基酸的构型 除甘氨酸以外，其余 20 种氨基酸的 Cα都是不对称碳原子（手性）。;甘氨酸的结构式;参与蛋白质组成的氨基酸在可见光区都没有光吸收； 在紫外光区只有色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸有吸收光的能力。其最大吸收波长(λ)分别为280nm、275nm、257nm； 是利用紫外分光光度计，在280nm波长处，测定蛋白质浓度的基础。 ;三、蛋白质的结构;;一级结构（primary structure）； 二级结构（secondary structure）； 超二级结构（supersecondary structure）； 结构域（structural domain）； 三级结构（tertiary structure）； 四级结构（quarternary structure） ; ;1.肽和肽键;;　　　　　　　;氨基酸残基（amino acid residue）;蛋白质一级结构的表示法;⑴ 谷胱甘肽 ⑵ 脑啡肽（5肽） ⑶ 短杆菌肽S（10肽） ⑷ 肽类激素;（二）蛋白质的三维结构 ;1.蛋白质的二级结构 2.蛋白质的超二级结构和结构域 3.蛋白质的三级结构 4.蛋白质的四级结构 5.稳定蛋白质构象的作用力;蛋白质结构层次 ;1.基本知识;肽单位平面结构;;二面角（dihedral angle）; 多肽链主链骨架的构象是由每个Cα的成对二面角（Φ，Ψ）所决定的。 ②非键合原子间的最小接触距离 在相邻的两个肽单位的构象中，非键合原子间的接近有无障碍??是否符合标准接触距离，即能量是否达到最低，也是肽链构象能否稳定存在的重要立体化学原则。;2.?二级结构;（1）α-螺旋;每隔3.6个氨基酸残基，螺旋上升一圈，每圈间距0.54nm. 氢键环内包括13个主链原子，因此称这种螺旋为3.613螺旋。 ; 电子显微镜下的人体头发;（2）β-折叠;反平行式较为稳定，例如在丝心蛋白中存在稳定的反平行β–折叠。 ;（3）β-转角;（4）无规卷曲; （1）超二级结构 相邻的二级结构单元（主要是α–螺旋和β–折叠）组合在一起，形成有规则的、空间上能够辨认的二级结构的组合体，充当三级结构的构件，称为超二级结构（supersecondary structure）。;;（2）结构域; 结构域之间常常只有一段肽链相连，形成所谓“铰链区”（hinge region），使结构域容易发生相对运动。结构域之间的这种柔性（flexibility）有利于如酶和抗体活性的发挥。;4.三级结构;5. 四级结构;烟草花叶病毒（TMV）示意图;蛋白质结构层次 ;5.?稳定蛋白质构象的作用力;四、蛋白质结构与功能的关系 ; 1. 一级结构变异与生物进化 在不同生物体中行使相同或相似功能的蛋白质，称为同功能蛋白质。 它们的氨基酸序列具有明显的相似性，这种现象称为序列同源，有明显序列同源的蛋白质，也称同源蛋白质。 ; （1）同源蛋白质完全相同的氨基酸残基，称不变残基，它们决定了蛋白质的空间结构与功能。 （2）有相当大变化的氨基酸残基，称为可变残基，它们的差异体现了种属特异性。 因此，对不同生物来源的同功能蛋白质的一级结构进行比较研究：可以帮助我们了解哪些氨基酸对其活性是重要的，哪些是不重要的；可为生物进化提供新的可靠依据。 　　;2.一级结构变异与分子病;正常红细胞和镰刀状红细胞的扫描电镜图谱; 一级结构相似，可能会有相同的功能；一级结构有差异，功能会不同。如OX与ADH:; 不同生物（哺乳动物、鸟类、鱼类）来源胰岛素分子一级结构，发现组成的 51 个氨基酸残基中，只有 24 个氨基酸残基始终保持不