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昆虫分子生态学.ppt
昆虫分子生态学 昆虫生理生态学 昆虫种群生态学 昆虫群落生态学 生态系统生态学 谢 谢 ! * 昆虫分子生态学的 主要原理与研究方法 陈 川 以昆虫为研究对象,研究昆虫及其周围环境相互关系的科学。它是昆虫学和生态学的分支学科。 昆虫生态学(Insect ecology) 按研究对象的层次分类: 昆虫生态学 一.主要原理 分子生态学是应用分子进化和群体遗传学的理论、分子生物学的技术手段、系统发生学和数学的分析方法以及其他学科的知识(如地学、古气候学等)去研究种群、进化、生态、行为、分类、生物地理演化、生物保护等学科领域的各种问题。它主要通过大量使用分子生物学先进的技术和方法,在分子水平上研究生态现象,阐明生态现象的分子机制。 昆虫分子生态学就是以昆虫为研究对象,应用分子生态学的原理与方法研究昆虫进化与适应机制的一门学科。 1.基本原理 通过分子生物学的方法检测昆虫种群或个体的遗传变异,分析和解释遗传变异的特点与规律,揭示遗传变异所反映的规律性的东西,从而进一步阐明昆虫之间以及昆虫与环境之间的相互作用关系。 其研究的最典型特色是运用分子遗传标记来检测研究对象的遗传变异特征,以揭示事物所隐含的演化规律。 2.主要理论 分子生态学是建立于群体遗传学理论、分子进化理论和系统发生学理论等理论支柱之上的实验性和理论性都很强的科学。与之相关的一些主要理论有: (1)种群分化 (2)随机遗传漂变 (3)归祖理论 (4)中性理论 (5)哈德-温伯格理论 二.昆虫分子生态学的研究方法 昆虫分子生态学研究包括2个核心部分,即分子标记的建立和分子数据的获取。其中,分子标记的建立是关键。 1.分子标记的方法 ①同工酶(蛋白质电泳技术)方法; ②限制性片段长度多态性(RFLP)方法; ③随机扩增DNA多态性(RAPD)方法; ④微卫星DNA和小卫星DNA标记方法; ⑤扩增片段长度多态性(AFLP)标记。 表1 昆虫分子生态学常用技术比较 需要专一性引物。 只需要少量的DNA,可以通过EB显色而不用放射性探针标记,相对便宜且比标准的RFLP灵敏。 基因频率资料 PCR-RFLP 要求大量的DNA,通常要求放射性标记探针,只能分析单个或几个座位,相对较贵,对技术与操作要求较高。 常用于mtDNA,效果较好,也较为方便,有标准的探针以供比较之用。 通过限制性内切酶能识别单个位点的核苷酸差异、基因频率和碱基对差异。 RFLP 与DNA系列方法相比灵敏度较差,较多的试验数量局限于小型昆虫,酶易受环境条件影响。 相对便宜,已有的方法较多,产生在生理上重要的共显性孟德尔遗传。 氨基酸所带电荷及电性,基因频率资料。 同工酶 (蛋白质电泳技术) 缺点 优点 区别水平及 所获得资料类型 技术名称 相对较贵且费时,步骤较繁。 兼有RFLP的可靠性与PCR的高效性,只需少量的DNA且相对纯度要求不高,重复性比RAPD好,预先不必知道引物序列。 同RFLP AFLP 费时费钱,,在技术上比PCR-RFLP和RAPD要求更高。 只需相对少量的DNA,分辨率高,一些通用的PCR引物。 核DNA和mtRNA单一核苷酸的差异;基因频率和碱基对变化。 DNA序列 相对较多的高纯分子质量DNA,要求有标记探针,相对较贵且费时,难以获得可靠的PCR产物。 鉴别力高、较快且较为便宜,能鉴定专一性定位点,专一性高,对复杂的交配系统尤其适用。 个体和群体间核DNA串联序列的差异。 微卫星DNA 同RFLP 小卫星DNA 对DNA浓度十分敏感,在PCR产物中不能提供任何遗传信息,重复性较差,所做的标记难以鉴定。 对已知的遗传信息较少的种较为适用,频率高,相对便宜,只要求少量的DNA. 核DNA中单核苷酸的变化,基因频率资料。 RAPD 2.遗传变异的检测方法 从所揭示的遗传变异信息的类型和层次上看,遗传变异的检测方法包括两大类: (1)序列分析(sequence analysis) 直接对DNA标记的核苷酸组成进行分析; (2)片段分析(fragment analysis) 通过检测多肽片段的长度或构象来区分不同的基因型。 进行遗传变异的最基本的检测方法是电泳技术。 三.昆虫分子生态学研究内容 (1)由于昆虫迁飞、扩散或外来种、地理隔离的 昆虫种群在分子水平上的遗传多样性及遗传结构; (2)昆虫种群的生物型; (3)昆虫—植物相互作用的分子机理; (4)昆虫抗药性分子机理; (5)昆虫对环境适应(如耐寒性)的分子机理。 四.昆虫分子生态学的应用 1.昆虫地理种群的遗传变异分析 2.昆虫生物型差异的分子特征 3.昆虫嗅觉的分子识别 4.昆虫与共生菌互作
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