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生物信息和CADD
生物信息和CADD
计算机辅助药物筛选平台
赵勇
目录
•生物信息与精准医疗
•分子诊断与高通量测序
•靶向药物研发
临床数据分析报告
• 每年10万美国人死于药物的副作用。(4th)
• 每年200万美国人因药物的副作用而就医。
• 病人对不同的药物的治疗反应介于20%到75%之间
(PricewaterhouseCoopers (PwC))。
引起药物反应个体差异的机制
身高、体重 基因型
占70%
决定因素
性别
环境因素
食物/ 吸烟/
合并用药
年龄
老年、儿童、
新生儿
病程
合并症 器官功能
什么是基因?
Gene
DNA
Transcription genomics
molecular
RNA biology
Translation
structural
Protein Protein folding biology
biophysics
从基因到蛋白质
ATGGAGGAGCCGCAGTCAGA
T
CCTAGCGTCGAGCCCCCTCT
G
AGTCAGGAAACATTTTCAGA
C
CTATGGAAACTACTT
.
MEEPQSDPSVEPPLSQE
TFSDLWKLLPENNVL……
DNA / amino acid
sequence 3D structure protein functions
DNA (基因) →→→ RNA前体→→→ RNA →→→ 蛋白质
RNA-polymerase Spliceosome Ribosome
体细胞突变与癌症
• 单核苷酸变异(Single Nucleotide Variations, or SNVs)
–Substitutions
• INDEL (Small insertion
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