中国南海北部陆坡沉积物古菌多样性及丰度分析-微生物学报.PDFVIP

微生物学通报 Jul. 20, 2017, 44(7): 1589−1601 Microbiology China /wswxtbcn tongbao@ DOI: 10.13344/j.microbiol.china.170159 研究报告 中国南海北部陆坡沉积物古菌多样性及丰度分析 1,2,3 4 1,2,3 1,2,3 1,2,3 1,2,3* 范习贝 梁前勇 牛明杨 余甜甜 王寅炤 王风平 (1. 上海交通大学生命科学技术学院 上海 200240) (2. 上海交通大学 微生物代谢国家重点实验室 上海 200240) (3. 上海交通大学 海洋工程国家重点实验室 上海 200240) (4. 中国地质调查局广州海洋地质调查局 广东 广州 510760) 摘 要：【目的】海洋沉积物中的古菌在全球生物地球化学循环中充当重要的角色，深入了解 沉积物中古菌群落的结构及功能特征是探究海洋沉积物中古菌参与生物地球化学循环和生态 学功能的基础。【方法】采用高通量测序技术，分别对南海北部陆坡不同海域( 东部，西部和 神狐海域的7 个站位)沉积物中古菌16S rRNA 基因进行Illumina MiSeq 测序。【结果】中国南海北部 陆坡沉积物中古菌的主要门类是 Bathyarchaeota 、Thermoplasmata 、Woesearchaeota (DHVEG-6) 、 Thaumarchaeota (Marine Group I) 、Lokiarchaeota 和Marine Hydrothermal Vent Group (MHVG) ， 还存在少量的AK8 、Marine Benthic Group A 和Terrestrial Hot Spring Crenarchaeota Group (THSCG)等。在潜在水合物区沉积物中还发现了甲烷代谢相关古菌(Anaerobic methanotrophic archaea ，ANME)类群，主要为ANME-1 、ANME-2ab 和ANME-2c 等。甲烷代谢古菌的分布 特征也从甲烷代谢保守功能基因 mcrA (Methyl coenzyme-M reductase A)的扩增中得到了验 证。利用定量PCR 对南海沉积物中的细菌、古菌的 16S rRNA 基因和mcrA 基因进行了定量， 发现细菌 16S rRNA 基因拷贝数为 105−107 copies/g ( 湿重) ，古菌 16S rRNA 基因拷贝数为 5 6 3 5 10 −10 copies/g (湿重) ，潜在水合物区mcrA 基因拷贝数为 10 −10 copies/g (湿重) 。【结论】揭 示了中国南海北部陆坡沉积物中具有丰富的微生物资源，其中古菌种类多样且丰度较高，同时 发现冷泉特征古菌群落，为深入认识和理解南海沉积物中微生物丰度和古菌多样性，以及解析 古菌地球化学功能奠定基础。 关键词：中国南海北部陆坡，沉积物，古菌多样性，厌氧甲烷古菌，深古菌门，mcrA 基因 Foundation item: National Natural Science Foundation of China (No.