刺参肠道及养殖池塘茵群组成-渔业科学进展.PDFVIP

第 31卷 第 3期 渔 业 科 学 进 展 Vo1．31，NO．3 2010年 6月 PROGRESS IN FISHERY SCIENCES Jun．，2010 研究简报 刺参肠道及养殖池塘茵群组成 的PCR—DGGE指纹图谱分析 王轶南 朱世伟 常亚青 (大连海洋大学 农业部海洋水产增养殖学重点实验室，l16023) 摘 要 采用基于l6SrDNA 的PCR—DGGE指纹图谱技术对黄海北部刺参养殖池塘 (底泥、海水) 及刺参肠道的菌群组成进行 了初步分析。结果显示，从刺参肠道 、底泥及海水样品分别获得 41、31及 4l条扩增条带，其 中优势条带分别为 12、9及 1O条 ；三者具 20条共有条带，其 中4条为各样品的优 势条带，共有条带在各样品中的丰度不同；三者分别具 5、2及 13条特异条带，其 中肠道 中的第34、42 条带以及海水中的第 25、46条带丰度均较高；肠道与底泥 的菌群组成相似性系数 (戴斯系数)为 77．8％，二者与海水菌群组成的相似性 系数分别为 65．9 和 55．6 。 关键词 刺参Apostichopus＆ponicus 肠道 养殖池塘 菌群 PCR—DGGE指纹图谱 中图分类号 S917．1 文献识别码 A 文章编号2010)03—0l19O4 PCR—DGGE analysisofbacterialcommunitycomposition intheintestineandaquaculturepondofAposfZcDp japonicus W ANG Yi—nan ZHU Shi—wei CHANG Ya—qing (DalianOceanUniversity，KeyLaboratoryofMariculture，M inistryofAgriculture，116023) ABSTRACT Thebacterialcommunitycomposition in theintestineandaquaculturepondof ApostichopusjaponicusculturedatZhuanghe，Dalianwasprimarilyanalyzedwith16SrDNA PCR—DGGE fingerprint．Theresultsshowed that41，31and41bandswereobserved in the PCR—DGGE fingerprintofintestine，sedimentandseawater，with 12，9and10dominantbands respectively．20bandsdifferentinabundanceweresharedbyintestine。sedimentsandseawater。 and4ofthem weredominantbandsin eachsample．5，2and 13specialbandsappearedineach sample，inwhichband34，42from intestineandband25，26from waterwerewithhighera— mountthantheothers．Similaritybetweentheintestineandsedimentwas77．8 ，while65．9 wasdefinedbetweentheintestineandseawaterand55．6700betweenthesedimentandseawater． KEYWORDS SeacucumberApostichopusjaponicus Intestine Aquaculturepond Bacterialcommunity PCR—DGGE fingerprint 刺参 Apostichopusjaponicus又称仿刺参