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linux 集群登陆及投算作业-改2014.8.30
一、登陆到linux集群
(1)登录管理节点
登陆linux集群分为shell字符界面登陆和vnc图形界面登陆。首先在个人电脑安装Xmanage和 RealVNC软件,见群共享。
字符界面登陆用到xshell工具,双击打开xshell工具,输入ssh 99回车
然后输入用户名和密码,登陆到linux集群的管理节点mu01。
(2)修改登录密码
普通用户更改密码,在登录服务器mu01管理节点后,输入ssh cu01,进入cu01节点,然后输入yppasswd命令来修改密码,这样所有节点密码都会自动修改。(注:需输入两次新密码,输入时不会显示)
(3)上传、下载文件
点击绿色的new file transfer按钮打开xftp工具
左侧为本地硬盘,右侧为linux用户目录。打开本地硬盘,右键单击需要上传的文件或文件夹,选择upload即可把文件上传到linux用户目录下。
下载文件与上传相反,在linux用户目录下选择要下载的文件或文件夹,右键选择download即可下载文件到本地硬盘。
(4)启动VNC
由于comsol,fluent,matlab,abaqus软件都是图形界面软件,所以建议用以下vnc图形界面方式登陆cu01-cu04计算节点。
在第一次用vnc图形界面登陆时,先用xshell 登陆到字符界面下设置本账户的vnc图形界面,xshell登陆后先直接运行vncserver开启vnc功能,此时会提示输入密码,输入将要设置的密码,注意此密码是vnc的密码,与账户密码无关(建议设置与账户相同的密码),注意输入密码时没有显示。
用vncserver –list查看分配到的vnc号,如下记住 :1
然后打开VNC viewer工具输入ip地址56加“:1”的格式来登陆vnc图形。
提示输入VNC密码,打开用户桌面
若VNC号有两个及以上,或VNC连接不上,或登录错误,需要杀掉VNC号,用kill命令,例如杀掉“:1”
然后,再起VNC,输入vncserver回车,再输入vncserver –list 回车,查看重新分配的VNC号,注意只能存在1个VNC号。
备注:vnc更改密码,输入vncpasswd,按提示输入两次密码即可。
二、软件计算
由于集群资源很少,除去管理节点不参与计算外,就剩余4个计算节点,而软件和用户相对校多,所以不建议跨节点跑作业,即每个作业使用核数不要超过16核。
在要跑软件之前,先登陆到计算节点上用top命令查看目前是否有程序在运行。
在用户桌面,???击右键,选择Open in Terminal
例如在cu01上投算作业,输入ssh –X cu01,回车,转到cu01节点
输入top回车,再按“1”查看cu01节点CPU使用情况
若是0代表目前该核心空闲,可以运算作业。100代表cpu核心满负荷运算。若某个节点16个CPU负荷已很高,换至其余空闲节点运算作业。建议一个计算节点核心数最多使用15核。
按“Q”键返回,输入fluent 即可打开FLUENT 14.0软件
同理,输入matlab、comsol、abq6101 cae即可打开MATLAB R2009b、COMSOL 4.3、ABAQUS 6.10软件。
三、退出linux系统
(1)若软件正在运行,需要临时退出Linux系统,点击用户桌面右上角的“×”,关闭VNC,在Xshell中连续输入exit命令关闭Xshell,这样即使退出Linux系统,软件仍在计算。
(2)若软件计算完成或没有计算,在terminal中连续输入exit命令退出,点击用户桌面右上角的“×”,关闭VNC,再在Xshell中连续输入exit命令退出Xshell。
注意:
(1)投算作业需先登录管理节点mu01,再转到计算节点cu01~cu04
(2)mu01为管理节点,仅有1颗CPU,计算能力较低,请勿在该节点投算作业!
(3)服务器刀片数量有限,非大型运算或紧急运算,请勿在服务器上投算作业!
(4)如需在linux系统安装软件,请与管理员联系。
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