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最新SSR标记在马氏珠母贝系谱鉴定、有效亲本估计及性状关联分析中的应用
SSR标记在马氏珠母贝系谱鉴定、有效亲本估计及性状
关联分析中的应用
摘要
多年的大规模养殖,但还没有培_冉出优良的养嫡品种,致使养殖群体陛状退化,
导致我国海水珍珠质量明显降低、困际竞争力下降。因此加强遗传育种的基础
研究和分子标记辅助育种的应用研究.培育出生长快、个体大、肯珠性状好的
珍珠蛆品种具有重要意义。
以马氏珠母贝选育系F,为亲本,建立了36个家系,按照常规技术进行幼体培育
和海医养成。7个月后,随机选取4个家系,每个家系取样30个个体,利用筛选的
3个
微R星引物进irPCR扩增.分析候选家系的遗传结构和系谱。结果表明:(1)I
微J】星引物在四个家系中共捡测到39个等位基因,每个位点的等位基凶数在2-5之
53l一0
|1{lJ,四个家系的平均观测朵合度([to)为o597,平均期望杂台度(He)为
0474~0
507:(2)根据子代基田型成功的推断出四个家系的亲本基因型。以标记PMl42
为例.通过于代基因型推断出3#、4#、5#及10#四个家系坝亲的肇凼型分别为
3%
数量的增多,可掘此鉴别各个家系:用UPGMA法对120个样本进行聚类分析,98
的同一家系的子代个体能够聚到一起,分类结果tj系谱来源基本一致。结粜|兑明,这
四个家系具有较高的遗传多样性,但家系间已出现明显的遗传分化。山f此方法首次
成功应用在珍珠贝,为该物种群体系谱分析提供了一种新的便捷途径。
从快速生长系F,选择亲本进行群体繁殖,雌雄亲本数量分别为42和38个,人
j:解剖受精,按照常规技术进行幼体培育和海区养殖。从子代随机选取90个幼体.
利用45时微卫星标i0进进行PCR扩增,分析其遗传结构和有效亲本数最。结果其检
测到45个微卫星位点.186个等位基因,每个位点的等位基因数在2—9之州,平均
每个位点宵413个等位基因。平均观察杂合度为0543:平均Shannon多样性指数为
1 012:平均P1C值为o491。根掘基因频率的似然率算法成功的推断出该群体含有30
个仝H胞家系,有效亲本数量为60个,有75%的亲本参与了繁精。世代之问近交系
数增量AF=083%.F4代群体的近变系数F-3
27%。本研究结果|兑明:(1)媛选系F4
具有较高的遗传变异:(2)本实验是人工解剖受精.在此情况F糙子与卵子混合均匀
但是有效求本数量没有达到100%.推其原凶可能为某些采本问近变导致后代存活率
降低。
利用本实验宦自主丌发的50个马氏珠母贝EST.SSR标记,对马氏珠母贝F4代快
速生眭选育群体的90个个体基因组DNA进行PCR扩增,然后使用统计软件SPSS
对50个微卫星标U与马氏珠母贝总重、壳长、壳高、壳宽和韧带长相关性进行了方
差分析。结果显示,弛有18个微卫星标记与马氏珠母贝的5个生长性状相关.其它
32个标记对性状的影响末达到显著水平。研究发现9个标记与总重显著相关
(口c005);12个标记与壳长显著相关.其中3个是极显著相关;14个位点与壳高
显著相关,其中3个为极显著相关;6个位点和壳宽显著相关,其中一个标记为极显
著相关;5个标记与韧带长显著相关。对同一标记不同基因型问进行多重比较,找到
了与5种性状相关的基因型。该研究结果为马氏珠母贝生长性状的进一步QTL定位
和建克准确、有效的分子标i己辅助育种工作打下了良好的基础。
关键词:马氏珠母贝,微卫星标记,系谱分析,有效亲本数量.性状关联分
breedernumber
identification,effective
Genealogical
estimationandcorrelationwith
hereditary
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