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主要内容 转座因子的发现 转座因子的概念 转座因子的类型和结构特征 转座机制 真核生物转座子 逆转录病毒和反座子 转座的遗传学效应 一、转座因子的发现 二、转座因子的概念 最简单的转座子,不含有任何宿主基因。 是独立的单元,每个IS元件只编码转座酶。 是细菌染色体或质粒DNA的正常组成部分。 一类较大的转座子,除转座酶基因外,带有某些抗药性基因(或其他宿主基因)的转座子 复合转座子(composite transposon):带有IS的Tn 简单转座子(simple transposon):不含IS的Tn 它是Ecoli的一种温和噬菌体。与必须整合到宿主染色体特定位置上的一般温和噬菌体不同,Mu噬菌体并没有一定的整合位置。 与其他温和性噬菌体的差别:其基因组不论在进入裂解周期或处于溶源状态都可随机整合到宿主染色体的任何位置,且游离的和已整合的基因次序是相同的. 与IS和Tn两种转座因子相比,Mu噬菌体的分子量最大(38kb),它含有20多个基因。Mu噬菌体引起的转座可以引起插入突变,其中约有2%是营养缺陷型突变。 1)结构:线形DNA分子,38kb.不含IR 序列,游离MuDNA两端各带一段寄主DNA , 整合状态时会消失。 2)MuDNA左端含有与转座有关的A基因和B基因,分别编码分子量为70kb和33 kb的两种蛋白。 C基因编码的产物对A基因和B基因表达有负调节作用 右端含有G片段。 六.逆转录病毒和反座子 Retroviruses and retroposons 具有包膜,圆球状,直径为80~120nm 基因组是单正链RNA,3.5~9.0kb 病毒颗粒中有逆转录酶 能整合于宿主细胞的染色体 6.1.2 Lifecycle of retrovirus LTR(long-terminal repeat):长末端重复序列 David Baltimore 1970 Reverse transcription and Reverse transcriptase Enzymes involved Enzymes involved Enzymes involved Two fates of RNA: Translation:作为mRNA翻译成病毒的蛋白质 Packaging:作为病毒RNA基因组被装配成新的病毒颗粒 Packaging 2 RNAs in 1 virus 2 different but related viruses infect 1 cell = heterozygous virus 能编码逆转录酶和/或整合酶,因此能进行转座 有末端重复序列 但没有env基因,不能形成病毒颗粒,不能独立地感染其它细胞, 2 classes: Ty1 Ty917 Structure: ~ 6.3kb; 330bp direct repeats at each end mRNA of Ty: 5% of total mRNA in yeast Open reading frames: 2 Sequences: TyA: DNA binding protein; TyB: RTase, protease, integrase ~5kb; direct terminal repeat of 276 bp; 5 bp direct terminal repeats generated when integrated LINES(long interspersed elements) Transcripted by RNA Pol II Copy #: 20~50k per mammalian cell Structure: ~6500bp, not terminate at LTR open reading frames: 1 or 2 Sequences: RTase like sequence, endo- nuclease activity。 SINES (short interspersed elements) Transcripted by RNA pol III e.g.Alu family Alu family ~300,000 per haploid genome Structure: ~300 bp, AluⅠ site in 170 bp direct repeats at each end sequence related to 7sL RNA 1.靶位点形成正向重复序列(靶位加倍现象) 2.引起插入突变; Hemophilia(血友病): a “jumping disease” 3.转座子从原位点切离 准确的切离使插入失活的基因发生回复突变,不准确的切离则不发生回复突变,而是造成序列变异 5.启
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