蛋白质组学-2010级研究生基因组学和蛋白质组学课件3.pptVIP

主 要 应 用 筛选与特异抗体或受体相互作用的蛋白质 研究抗体或受体的结合位点 构建随机肽库、抗体库和蛋白文库 改造和提高蛋白质的生物学和免疫学特性 研究新型多肽药物、疫苗和抗体 研究涉及到蛋白质与核酸相互作用的生物学过程和新型的基因治疗导向系统 * * 噬菌体展示技术的应用现状 抗体： 抗狂犬病毒的单链抗体， 抗HIV-1囊膜糖蛋白的单链抗体，此抗体可专一性杀死被HIV-1感染并表达有gp120的淋巴细胞, 中和响尾蛇毒素的单链抗体， 等等。 * * 疫苗： 展示在噬菌体表面的HIV-1 的gp120-V3 环 可象天然抗原一样引起显著的免疫应答, 等等。 * * 3. 多肽类药物： 如一些激动剂或拮抗剂从多肽库中分离鉴定出来；已获得一13 肽，它能中和蛇毒 α-bungarotoxin；从CX7C 多肽库中掏选到一个多肽能与 Hantavirus 结合，并使该病毒不能结合或感染细胞。人血管促生素（angiogenin）是一种能促进肿瘤血管生长的蛋白，用这个蛋白去淘选一个噬菌体展示多肽库，所获得的一个环状8肽能与血管促生素结合，并能阻遏血管促生素的活性；等等。 * * 肿瘤药物导航载体： 用肿瘤细胞特殊的受体蛋白从展示文库中淘选到的多肽或单链抗体，可以作为抗癌药物的定向输送工具 。一个成功的实例是：将噬菌体多肽展示库注射入具有肿瘤的小鼠体内，然后杀死小鼠，取出肿瘤，再将结合其上的噬菌体洗脱下来。展示在其上的多肽具有与该肿瘤的特异性亲和力。将此多肽与细胞毒素 doxorubicin 偶联。结果显示，此偶联物具有更强的抑制肿瘤的效果. * * 例：碱性磷酸酶，蛋白水解酶类，等等 5. 酶： * * 底物与抑制剂： 主要是蛋白酶的底物和其抑制剂。 * * 信息传递研究: 利用噬菌体展示多肽库，发现了一些受体，如凝血致活酶、黑皮质素受体、CD80 和一个 Hantaviral 受体；受体的配体， 如血管促生素、 α-bungarotoxin， 和一些大蛋白分子中的折叠区域，如　SH2、SH3 和 WW 区域。从多肽库中可分离到与天然激素相似的、与受体结合的高亲和力的多肽, 因此用完整细胞可以从多肽库中找到受体的高选择性配体。在不知道任何有关的受体和配体信息的情况下，用完整细胞和组织或动物，可筛选到特异与靶组织结合的多肽和蛋白。 * * 8. DNA结合蛋白： 锌指蛋白是一类 DNA 结合小肽结构物，这些结构含有锌，能用于构建一个大的蛋白区域，去识别和结合特殊的 DNA 序列。噬菌体展示技术也可以用于创造一个大的、具有识别不同 DNA 序列的 锌指的多肽库。利用这个多肽库，可以研究有关氨基酸序列与 DNA 结合位点之间的识别规则，可以通过设计 锌指多肽去控制基因的表达，比如抑制小鼠细胞系中的癌基因，也可以启动表达质粒的基因，或干扰病毒感染生活周期。 * * 1．? 9. 蛋白质组学： 噬菌体展示技术作为一个多肽和蛋白质合成的工具箱，使得任何蛋白均能找到与其有特异结合力的多肽和蛋白质，其构建的文库的滴度可达1012。蛋白质组学的基本点就是利用蛋白质-蛋白质的相互作用，对成千上万种蛋白质同时进行分析。而噬菌体展示技术正好能符合这种要求。例：将噬菌体展示cDNA 文库制成蛋白点阵，成功的应用于寻找与过敏症有关的蛋白质。 * * 主要优点 在细菌外完成 高度的选择性 亲和纯化反应高效性 不需要了解筛选分子结构 * * 酵母双杂交应用举例 蛋白级联底物的鉴定 钙调蛋白与L-异天冬氨酰甲基转移酶的相互作用 E2F1 突变子的遗传特性 多肽荷尔蒙受体相互作用 Pha-4在线虫 C. elegans 中 的相互作用 * * 参考文献 Bartel, Paul, C. Chien, R. Sternglanz, S. Fields. “Elimination of False Positives that Arise in Using the Two-Hybrid System.” Biotechniques (1993) Vol. 14, no. 6, p. 920-924. Chien, Cheng-ting, P. Bartel, R. Sternglanz, S. Fields. “The two-hybrid system: A method to identify and clone genes for proteins that interact with a protein of interest.” Proc. Natl. Acad. Sci