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2016广东科技奖-武汉植物园
参与申报(推荐)2016 年度广东省科技奖- 自然科学类项目公示内容
项 目 名 称 :蕨类植物叶绿体基因组的结构变异与进化动态研究
主要完成单位:中山大学、中国科学院武汉植物园
主要完成人:苏应娟、王艇、高磊
项 目 简 介 :
本项目属于生物科学中植物学领域。
蕨类植物是维管植物中仅次于被子植物的第二大类群,随被子植物的兴起蕨类植物不仅没有衰退,反而还发生
过“辐射式”物种形成。这颠覆了长期以来认为蕨类代表的是进化“盲端”的观念,必须对其进化潜力给予重新审
视。为此,我们开展了蕨类植物叶绿体基因组学的结构变异与进化动态研究,通过系统研究,取得以下原创性成果:
(1)测定了孑遗树蕨桫椤叶绿体基因组的全序列,阐明了桫椤cpDNA的一般特性、基因容量和组织方式;注意到它
拥有一特殊区域,内含串联重复;指出含trnR-UCG基因是树蕨类的独有特征;在trnD-GUC基因处鉴定出一个新倒位。
(2)测定了蕨类植物海金沙和南国田字草的叶绿体基因组全序列;确定海金沙cpDNA的组织方式代表的是蕨类从
“基部型”向“核心型”转换的中间类型;证明了反向重复区对cpDNA发生碱基替换起限制作用。
(3)揭示了蕨类叶绿体基因组rpoB-psbZ区(BZ区)的进化动态。在华东瘤足蕨的BZ区鉴定出一种新的基因顺序;
发现南海瓶蕨、节节草和问荆的trnY-trnE基因间隔区富含串联重复,导致长度急剧扩张,且串联重复同trnY基因
编码反密码子茎环的序列相关。
(4)应邀发表了长篇综述,利用叶绿体基因组全序列基于极大似然法重建了蕨类及其他陆生植物的系统发育。
(5)开展了蕨类植物重要功能基因的分子进化研究。对蕨类psbA基因、CVNH基因以及NEO基因进行了分子进化分析,
为研究功能基因在蕨类植物适应性种群分化中的作用奠定了基础。
项目揭示了蕨类植物叶绿体基因组在基因容量、基因顺序以及tRNA基因重复、BZ区在序列长度等方面存在高水平
变异;首次在基因内水平给出了反向重复区能减低叶绿体基因进化速率的直接证据。功能基因在蕨类植物适应性种
群分化中所起的作用,为理解蕨类应对被子植物兴起后的陆地生态环境改变提供了新的视角。
10篇代表性论文IF合计24.22,在SCI刊物上被他引61次。20篇代表性论文IF合计45.145,在SCI刊物上被他引139
次,研究水平达到了国际先进水平。桫椤是第四种完成叶绿体基因组全序列测定的蕨类植物,也是我国测定的第一
个蕨类植物叶绿体基因组全序列(代表性论文1),已被SCI论文他引18次。发表在Genome Biology and Evolution
的论文(代表论文3)2014年获湖北省自然科学优秀学术论文一等奖。特邀综述(代表性论文4)至今已被SCI论文
他引24次,2015年获Journal of Systematics and Evolution的Outstanding Paper Award。二位主要完成人分别
担任中国植物生理与分子生物学学会孢子植物生理与分子生物学分会的理事、中国植物学会植物分类与系统进化专
业委员会委员、中国花卉协会蕨类植物分会第四届理事会理事、《PLoS ONE》编委、《生物多样性》编委和《植物科
学学报》编委。其中一位主要完成人入选中国科学院“百人计划”引进国外杰出人才。研究成果为进一步探讨蕨类
植物的叶绿体的进化潜力奠定了基础,对相关学科的发展产生了极大促进作用。
10篇代表性论文、专著
年卷
发表 知识产
页码
论文专著名称/ 影响 时间 通讯 第一 SCI 他引 他引总 权是否
序
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