3 酶的催化机制.ppt

第三章 酶催化作用机制 酶为什么具有如此高的催化效率和专一性? 这与酶催化作用的机制有关。 酶和底物的相互作用和变化过程称之为酶的作用机制。 第一节 趋近与定向效应 趋近效应：在酶促反应中，由于酶和底物分子之间的亲和性，底物分子有向酶的活性中心靠近的趋势，最终结合到酶的活性中心，使底物在酶活性中心的有效浓度大大增加的效应。 定向效应：当专一性底物向酶活性中心靠近时，会诱导酶分子构象发生改变，使酶活性中心的相关基团和底物的反应基团正确定向排列，同时使反应基团之间的分子轨道以正确方向严格定位，使酶促反应易于进行。 以上两种效应使酶具有高效率和专一性特点。 当酶与底物靠近时，不仅酶构象受底物作用而变化，底物分子也常常受酶作用而变化，也就是酶使底物分子中的敏感键发生“变形”，从而促使底物中的敏感键更易于破裂。因而更容易形成一个互相契合的酶—底的复合物而提高催化效率。 第三节 酸碱催化机制 分为两种： 狭义酸碱催化：由H＋或OH－来催化反应 广义酸碱催化：由质子供体或质子受体来催化反应 这里指的是广义的酸碱催化。酶活性中心的一些基 团（如：氨基、羧基、酚羟基、咪唑基等）可作为 质子供体或受体对底物进行催化，从而加快化学反 应速度。 第四节 共价催化机制 第五节 微环境效应 酶活性中心多半靠近位于疏水微环境 的凹陷中，疏水环境中介电常数较低，故 在疏水环境中两个带电物（底物、酶中心） 之间的静电作用力显著增加，从而使反应 速度加快。 核酶（ribozyme） * 第一节 趋近与定向效应 第二节 构象变化效应 第三节 酸碱催化机制 第四节 共价催化机制 第五节 微环境效应 第六节自我剪接、剪切机制 普通化学反应—随机碰撞（受浓度、碰撞角度影响） 相当于——社会上的自由恋爱 酶的活性中心—相当于“婚姻介绍所” 邻近作用提高了酶活性（“婚介”）中心的底物浓度（—非婚男女集中） 定向作用缩短了底物与催化基团间（“男女”）的距离 提高反应速度（成功率）108倍 第二节 构象变化效应 底物分子发生形变 酶 底物 同时形变 产物 酶分子中可以作为广义酸、碱的基团 某些酶能与底物形成一个反应活性很高的共价中间复合物。底物只需越过较低的活化能就可以形成产物，从而提高了反应速度。 共价催化又分为亲核催化和亲电催化。 亲核基团： His 的咪唑基，Cys 的硫基，Asp 的羧基，Ser 的羟基等； 亲电子基团：H+ 、Mg2+、 Mn2+ 、Fe3+ 某些辅酶，如焦磷酸硫胺素和磷酸吡哆醛等也可以参与共价催化作用。 第六节 自我剪接、剪切机制 自我剪接： 核酶通过酶RNA或其辅助因子上所含嘌呤-OH攻击分子本身的剪切点，而催化自我剪接反应。 自我剪切： 具有独特空间结构和构象，并且具有特定的保守序列和剪切点序列的核酶在剪切位点的自我切断。 四膜虫rRNA成熟中RNA的自我剪接 自我剪切