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凝集素芯片使用说明
材料目录
芯片凝集素点阵
凝集素芯片保存方法
凝集素芯片使用方法
所需试剂及其配置方法
凝集素亲和性表
一
芯片上各个凝集素点阵
□ AAL BPL DSL DBA ECL
AAL BPL DSL DBA ECL
? EEL HHL Jacalin LTL MAL Π
EEL HHL Jacalin LTL MAL Π
? MPL NPL WBA EBL STL
MPL NPL WBA EBL STL
? SBA UEA WGA SWGA WFL
SBA UEA WGA SWGA WFL
? ? ? ? ?
说明:1、□是荧光位置标记位点,作为坐标
2、每个凝集素重复两个点。
二、凝集素芯片保存方法
将凝集素芯片放在芯片盒内(注意不要互相接触),放入4℃冰箱冷藏,可保持3-6个月。
三、凝集素芯片使用方法
(一) 对细胞的检测
细胞系细胞提取
取对数生长期的细胞,倾去培养液,加入0.25%胶原酶Ⅳ(D-hanks),37 ℃消化1 h,每隔10 min吹打一次。1500r/min离心5 min,收集沉淀。PBS洗涤2次,重悬备用(注:用胶原酶主要是怕损伤细胞膜糖链结构,如果没有,常规细胞培养的胰蛋白酶也可)
如果对细胞进行荧光标记,在重悬后的细胞液中加入50-100ul的吖啶橙溶液,轻摇5min后PBS洗涤两次,重悬备用。
体液细胞悬液的制备
胸腔积液、腹水等1500r/min离心5min后,倾倒上清液。按1:3的比例向细胞沉淀中加入ELS裂解液去除红细胞,轻轻吹打混匀。1500 r/min离心5 min,收集沉淀。PBS洗涤2次,重悬后进行细胞计数(1×104—1×106)。取少许上述细胞悬液,孵育到凝集素芯片上(如需荧光标记,重复上面荧光标记步骤)。
组织细胞提取
取动物组织,用肝素D-hanks液清洗后剪碎,0.25%胶原酶Ⅳ(D-hanks),37℃消化1h,每隔10min吹打一次。1500r/min离心5min,按1:3的比例向细胞沉淀中加入ELS裂解液去除红细胞,轻轻吹打混匀。1500 r/min离心5 min,收集沉淀。RPMI 1640洗涤2次,重悬备用。
凝集素芯片孵育
取出备用的凝集素芯片,于37℃湿盒内水化30 min,0.5%酪蛋白溶液(PB,0.01 mol/L, PH=7.2)封闭5 min,PB缓冲液(0.01mol/L,pH=7.2)洗涤15 min,将细胞悬液滴加到芯片上,覆盖住凝集素芯片矩阵,常温或者37 ℃孵育40 min,PBS缓冲液(pH 7.2)洗涤,3%戊二醛(PBS,pH 7.2)固定2 min(如不染色,固定一步可以省略)。
凝集素芯片捕获细胞的检测
荧光标记的检测
激光扫描仪扫描整个芯片
常规P巴氏染色(Papanicolaou’s stain),观察捕获细胞位点,显微镜下观察(注:PE染色后吖啶橙荧光消失)。
对蛋白的检测
芯片准备处理同前
检测方法
蛋白直接荧光标记,扫描检测
蛋白捕获后,加荧光二抗孵育,扫描检测
蛋白孵育后,加其他标记的二抗检测。
四、所需实际配置方法
1、凝集素芯片封闭液
0.5%酪蛋白溶解到PH=7.4的PB溶液里(0.01M),溶解过程需要煮沸加热,分装冻存。
2、吖啶橙染色液
0.05%吖啶橙PBS溶液。
五 芯片所用凝集素亲和性
凝集素 来源 糖链特异性 DSL Datura stramonium (GlcNAc)n, polyLacNAc and LacNAc (NA3, NA4) MPL Maclura pomifera Galβ1-3GalNAcα-Thr/Ser (T) and GalNAcα-Thr/Ser (Tn) WBA Psophocarpus tetragonolobus α-GalNAc and Gal Jacalin Artocarpus integrifolia Galβ1-3GalNAcα-Thr/Ser (T) and GalNAcα-Thr/Ser (Tn) LTL Lotus tetragonolobus Fucα1-3GlcNAc, Sia-Lex and Lex SBA Glycine max Terminal GalNAc (especially GalNAcα1-3Gal) BPL Bauhinia purpurea alba Galβ1-3GalNAc and NA3, NA4 WFL Wi
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