国际通用的医学信息检索语言及其应用.doc

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国际通用的医学信息检索语言及其应用   1引言   近些年来,信息技术和网络技术的飞速发展大大推动了医学信息管理的数字化和标准化,以临床医疗信息为核心的电子病历的应用日渐普及,在标准化信息基础上建立的集成医疗信息系统通过一系列搜索引擎与受控词表和分类表相连接,使得分布在电子病历系统、临床检验系统、医嘱处理系统、重症监护系统、医学影像管理系统以及临床决策支持系统中的信息能够顺利地传递和共享。   医学信息标准化包括信息管理标准化与信息检索标准化,前者是对医学信息收集、存贮、处理、传递等信息管理过程实施标准化,包括医学信息系统集成架构规范、医学数据交换格式规范,如HL7(HealthLevel Seven International)和DICOM(Digital Imagingand Communicationsin Medicine)。后者则侧重医学知识组织和信息检索的规范化,包括医学数据文档结构标准(如CDA等)、医学元数据标准、电子病历标准、电子健康档案标准以及医学信息检索语言规范等[1].   检索语言能排除自然语言中的多词一义、一词多义和词义含糊现象,对内容相同及相关的情报加以系统化或组织化,揭示其相关性,其应用直接影响着信息检索的效率[2].具体到医学信息检索和医学信息管理中,标准化的检索语言对医学术语进行规范化的语义描述,如关于某种疾病的分类代码或者关于患者症状的术语描述[3],是CDA结构化文档和HL7信息交换中采用的术语和代码集的重要组成部分。检索语言的自然语言化和自然语言的规范化极大地满足了人们对医学信息的检索需求,实现了病人所有诊疗数据的“无缝”共享,使不同系统中的信息能够顺利传递和共享,方便数据的进一步挖掘与决策分析。本文着重介绍医学信息检索语言在国内外医学信息管理和检索中的应用情况。   2国际通用的医学信息检索语言及其应用   图1列举了一些国际通用的医学信息检索语言,本文着重介绍目前在医学信息系统中应用最为广泛的几个医学术语系统。   2.1医学主题词表(MeSH)   《医学主题词表》(Medical Subjec tHeadings,简称MeSH),由美国国立医学图书馆(NLM)编制,1960年出第一版,是目前国际上最具代表性、使用范围最广泛的受控检索语言。MeSH汇集了约25000多个医学主题词,按照词义范畴和学科属性进行分类,并按照字顺和树状结构分别进行排列。越上层的概念包括范畴越广,越下层的概念专指度越高。其等级结构能够精确揭示主题词的属分关系,了解主题词的族性类别;同时,基于概念的主题词、概念、术语结构相互关联,可揭示MeSH主题词之间的历史演变和语义关系,实现同义扩展检索。   MeSH在医学文献检索中的重要作用主要表现:   其一,对各种同义词、多义词和同形异义词进行了规范化处理,使得一个概念只能用一个词汇来表达,将自然语言转换成规范化检索语言;其二,保证文献标引者与检索者用词的一致性,提高检索效率。目前,用MeSH标引的医学文献数据库主要有:AIDSLINEAIDS、AODSTRIALS、AVLINE、BIOETHICS、CANCER-LIT、HEALTH、MEDLINE、TOXLINE等[4].树状结构表和字顺表是MeSH的主要组成部分。   (1)树状结构表:树状结构表将主题词按学科性质、词义范围、上下类属、派生关系等分别划分为16个大类,再划分为若干级子类。每一级类目用一组号码标明,级与级之间用“.”号隔开,并用逐级缩格的排列方法来表达它们之间的逻辑隶属关系。同级类目下的主题词按字顺编排,可满足族性检索需求。大多数情况下,一个主题词一般归入一个类别,但有些主题词具有多重属性,可能同时属于两个或多个类目范畴,这样就有与类目相对应的多个树状结构编码,便于查寻该主题词在所有类目中的位置。例如:肝肿瘤(Liver Neoplasms)有三个树状结构编码,分别属于肿瘤类下的消化系统肿瘤(C04.588.274.623)、消化系统疾病类下的消化系统肿瘤(C06.301.623)和消化系统疾病类下的肝疾病(C06.552.697)[5].      (2)字顺表:它由主题词、款目词和副主题词混合按英文字顺排列组成。每个主题词下列有该主题词设立年代、树状结构编码、历史注释及各种参照系统。款目词主要收录同义词或近义词,用“see”参照指向正式主题词;副主题词前一般加“/”号和主题词相区别,用于与主题词进行组配,旨在提高概念的专指度。   在MeSH数据库检索中,用户输入一个主题词后,系统会自动显示与该主题词相应的副主题词,如分析(Analysis)、诊断(Diagnosis)、药物治疗(DrugThera-py)、药物效果(Drug Effects)等。字顺表和树状结构表通过树状结构号相联系。

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