the third chapter protein chemistry蛋白质化学 分子生物学教材.ppt

第 三 章 蛋 白 质 化 学;第三章 蛋白质化学;3.1 蛋白质化学概念;3.2 蛋白质的分类;3.3 蛋白质的化学组成;氨基酸的立体异构体;二、氨基酸的分类： 1、常见的天然氨基酸－－ 2、不常见的稀有氨基酸－－是正常氨基酸的 衍生物，在遗传上没有直接的三联密码。 3、非蛋白质氨基酸－－不在蛋白质分子中 出现的氨基酸。;苏氨酸;苯丙氨酸;脂肪族氨基酸;羟基氨基酸;含硫氨基酸;芳香族氨基酸;杂环氨基酸;羧基氨基酸（酸性氨基酸）;氨基氨基酸（碱性氨基酸）;亚氨基酸（碱性氨基酸）;酰胺氨基酸;总结： 天然氨基酸除脯氨酸和甘氨酸外，其余均 属于L-α-氨基酸。 除甘氨酸外，氨基酸均含有一个手性?-碳原子， 因此都具有旋光性和立体异构。 各种氨基酸的区别在于 侧链R基团（Radical)不同。;常见的天然氨基酸分类： 1、按营养状况分 2、按酸碱性分 3、按 极 性 分;Gly,Ala,Val,Leu.Ile,Phe,Met,Pro,Trp;;三、氨基酸的一般物理性质; 色氨酸、酪氨酸和苯丙 氨酸对紫外光有光吸 收。其吸收峰在 280nm左右，以色氨 酸吸收最强。;四、氨基酸的化学通性：P79 由氨基参加的反应： （1）与亚硝酸的反应 （2）与甲醛的反应 （3）成盐作用（HCl） （4）酰基化与烃基化反应 （5）脱氨反应（氨基酸的代谢）;（1）与亚硝酸反应 AA + 亚硝酸 → ?-羟氨基酸 + 氮气↑+ 水 用途：Van Slyke氏氨基氮测定法，用于氨基酸 定量和测蛋白质水解进行程度;用途：N末端氨基酸测定;用途： Sanger反应，N末端氨基酸测定;Edman （苯异硫氰酸酯法）氨基酸顺序分析法 实际上也是一种N-端分析法。此法能够不断重复 循环，将肽链N-端氨基酸残基逐一进行标记和解离。;氨基酸的化学通性：P91 由羧基参加的反应： （1）成酯和成盐反应（+ 醇） （2）酰氯化反应（酰化氨基酸） （3）成酰胺反应（Asn，Gln） （4）脱羧反应（+ 酶） （5）叠氮反应;氨基酸的化学通性：P83 由氨基和羧基共同参加的反应： （1）与茚三酮的反应 （2）氨基酸的两性解离 （3）形成肽键 （4）离子交换反应;（1）AA与茚三酮反应;（2）两性解离及等电点;图 丙氨酸的解离曲线;等电点的概念: 在适当的酸碱度时，氨基酸上的-NH3+和-COO- ??离度完全相同，此时正离子和负离子浓度相同， 净电荷为零；在电场中既不向阳极移动也不向阴极 移动，成为两性离子（或兼性离子），这时氨基酸 所处溶液中的pH值就是该氨基酸的等电点（pI）。 等电点（pI）时溶解度最小。;等电点的推导;[Ala+]=;整理：K1 K2 [Ala±]= [Ala±] [H+] [H+];中性氨基酸：pI = (pK1 + pK2 )/2 酸性氨基酸：pI = (pK1 + pKR-COO- )/2 碱性氨基酸：pI = (pK2 + pKR-NH2 )/2 pK1指α-羧基离解常数的负对数值； pK2指α-氨基离解常数的负对数值； pKR指侧链R基离解常数的负对数值。;?习题1 根据Glu的数据：pK1α-COOH ＝2.19， pK2α-N+H3＝9.67， pKR R-COOH ＝4.25， pI ＝3.22 ① 绘出滴定曲线 ② 指出Glu－和Glu＝各一半时的pH值 ③ 指出Glu总是带正电荷的pH范围;答案 ① 解：见图 ② Glu－和Glu＝各50%时pH为9.67 ③pH3.22时 Glu总带正电荷;;习题2 谷氨酸的pK1为2.6，pK2为4.6，pK3为9.6， 其等电点是：（ ） A. 4.6 B. 3.2 C. 7.1 D. 6.1;（3）形成肽键（peptide bond）;氨基酸残基与肽单位;氨基酸的化学通性：P91 由支链R基产生的反应： （1）SH基和－S－S－键 （2）OH基 （3）咪唑基;巯基（-SH）的性质;巯基（-SH）的性质;巯基（-SH）的性质;羟基的性质;咪唑基的性质;氨基酸的分析： 纸层析法：利用极性与非极性氨基酸在水和 有机溶剂中的溶解度不同的特点，在滤 纸上进行分离的方法; 柱层析法：根据氨基酸的离子交换反应的原 理，如HPLC; 薄层层析法：利用吸附原理进行层析的方法， 在玻板上的薄层吸附剂上进行。;;Thin-layer Chromatography;HPLC;氨基酸的制备： 水解蛋白质法 人工合成法 微生物发酵法;3.4 蛋白质的结构;比较构象和构型：p95 构型：一个化合物分子种原子的空间排列； 构象：表示一个多肽结构种一切原子沿 共价键转动而产生的不同空间排列。;一、蛋白质一级结构(