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StrandNGS – small RNA-seq
王玲;;软件界面;Recent Examples;比利时根特大学（Ghent University）的研究人员联合各大miRNA表达分析技术的供应商，全面评估了12种不同的miRNA表达谱分析平台的性能。这12个平台来自9个供应商，涉及到定量PCR、杂交和测序三种技术;Outline of small RNA analysis;;;9;Pre-Alignment QC;Pre Alignment QC;Alignment parameters;;The inspector for the Aligned Reads shows the number of reads that were found for each of the chromosome, both on the positive and the negative strand and contains some basic stats, such as number of bases covered and number of reads with 1,2 or more mismatches. ;Post Alignment QC;Base quality by tile per sample;;18;;Genic region QC plot;;;Filter by Tile Quality and by alignment status;;
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如果不是重测序，跳过;Quantification ;Quantification of active regions ;Quantification;;;Filter on expression;Fold Change;;;;Gene view upregulated hsa-miR-200b;38;Novel Detection Method;Novel Detection Report;41;Find Targeted Genes ;Targeted Genes;;数据上传支持的格式;
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microRNA Target Filter功能将上传的miRNA数据中的 miRNA 家族信息与其 mRNA 靶标进行关联
该功能可以轻松的筛选来自于TarBase, miRecords, Target Scan和Ingenuity Knowledge Base中预测的和实验验证的mRNA靶基因;;/;Questions?
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