沙地雀麦质膜水孔蛋白基因(bipip)和actin基因克隆和序列地分析.pdfVIP

摘 要 植物水孔蛋白在植物体内形成水分选择性运输通道，介导胞内或胞间的水分跨 膜运输，调节植物体内的水分平衡，对于提高克隆植物水分生理整合及抗盐、抗旱 性可能发挥着重要作用。研究以沙地雀麦（Bromus ircutensis Kom. ）为材料，通过 反转录聚合酶链式反应（RT-PCR ）和快速分离 cDNA 末端技术（RACE ），克隆得 到沙地雀麦的BiPIP 1- 1 基因和Actin 基因的全长cDNA 序列，对其进行生物信息学 分析。主要结论如下： BiPIP1-1 基因全长 cDNA 序列为 1077bp ，包含 54bp 的 5 端非编码区（5 UTR ），156bp 的3 端非编码区（3 UTR ），867bp 的完整的开放阅读框，编码288 个氨基酸。BiPIP1-1 具有MIP 家族的信号序列和质膜水孔蛋白基因的特征信号序列。 系统进化树结果显示，BiPIP1-1 属于PIP1 亚家族成员，与大麦水孔蛋白（HvPIP1-1） 的亲缘关系最近。推测的BiPIP1-1 基因三级结构中包含6 个跨膜结构域（Ⅰ～Ⅵ， 通过五个亲水环相连），B 环和E 环各形成半个跨膜螺旋(HB、HE) ，分别从膜的两 侧折向膜内，2 个NPA 基序位于中心。对沙地雀麦质膜水孔蛋白基因的克隆有助于 从分子水平研究其在横走根茎中的表达及水分在沙地雀麦生理整合过程中的影响机 理。 BiAct 基因全长cDNA 序列为1310 bp，包含44 bp 的5 端非编码区（5 UTR ）， 135bp 的3 端非编码区（3 UTR ），1131bp 的完整的开放阅读框，编码376 个氨基 酸。BiAct 中含有多个Actin 基因家族的特异性结合位点，包括ATP 结合位点、凝 溶胶结合蛋白位点、抑制结合蛋白位点等。系统进化树结果显示，沙地雀麦肌动蛋 白（BiAct ）与高梁肌动蛋白 （ZmAct ）的亲缘关系最近。沙地雀麦Actin 基因的分 离为沙地雀麦其它基因的表达和调控研究提供了内参基因。 关键词：沙地雀麦；水孔蛋白基因；Actin 基因；RT-PCR ；RACE Cloning and Sequence Analysis of Plasma Membrane Instrinsic Protein Gene (BiPIP) and Actin in Bromus ircutensis Kom. Abstract Plant aquaporin formed water selective passageway that mediate the water-transme- mbrane transportation of inside the cell or intercellular and adjust water balance in plants, which may play an important role to improve the water physiology integration of clonal plants and the salt, drought resistance. Study to Bromus ircutensis Kom. for material, Full-length cDNA sequence of BiPIP1-1 and BiAct respectively ware acquired by RT-PCR and RACE technology. Their structure of sequence of nucleotide and amino acid were analyzed by bioinformatics software. The mainly results as follows: BiPIP1- 1 full-length cDNA sequence consists of 1077bp, which includes the length of 54bp of the 5′ untranslated region, followed by a 156bp of 3 ′ untranslated regio