hivaids肺脾气虚证的转录组学分析-transcriptomics analysis of hiv aids lung-spleen deficiency syndrome.docx

摘要 摘要 HIV HIV/AIDS 肺脾气虚证的转录组学研究 PAGE PAGE 1 PAGE PAGE 10 摘要 目的：应用 mRNA 芯片以 HIV/AIDS 肺脾气虚患者为研究对象,正常人为对照组，全血 作为研究样品，检测 HIV/AIDS 肺脾气虚证和正常人体的差异性基因，分析其功能、 信号通路及相互关系，并找出与证候的相关性。通过整合基因表达谱芯片信息，探讨 相 关 mRNA 分 子 功 能 ， 构 建 艾 滋 病 肺 脾 气 虚 证 基因 分 子 网 络 。 方法：病例来源于河南省的艾滋病肺脾气虚证患者和同地区的健康对照，应用博奥公 司的 DNA chips 芯片，运用 BRB-ArrayTools (Version 4.1)软件对各种基因芯片数据进行 处理，差异基因筛选应用单变量样品配对 T 检验，基因本体功能和信息通路分析，主 要应用 DAVID Tools（ HYPERLINK / /）在线分析，基因相互作用分析，主要 应用 STRING（ HYPERLINK http://string.embl.de/ http://string.embl.de）。 结果：运用 BRB Array Tools4.0 软件对病人组和对照组的基因进行 t 检验，满足规定条 件下，信号点有 495 个，其中上调调信号点有 319 个，下调的信号点有 38 个。上调基 因的本体功能分析中，主要与蛋白质合成、分解、转运过程，离子通道，细胞核生成 有关；下调基因本体功能分析中，主要与细胞凋亡，免疫应答和酶活性有关。上调基 因信号通路中，主要与免疫应答和细胞凋亡有关；下调基因信号通路中 T 细胞、肿瘤 坏死因子受体 2 和细胞感染有关。差异基因相互关系分析，上调基因共有 150 个基因 相互紧密联系，组成了节点为 150 个，边为 261 的相互关系图。下调基因共有 24 个基 因相互紧密联系，组成了节点为 24 个，边为 71 的相互关系图。聚类分析，基因表达 谱可以把 HIV/AIDS 与健康人很好的分开。 结论：1. HIV/AIDS 肺脾气虚证与健康对照组具有各自的基因表达谱； 2. HIV/AIDS 肺脾气虚证的相关基因构成了其特有的分子网络； 3. HIV/AIDS 肺脾气虚证与许多和免疫、炎症反应相关的基因有密切关系。 关键词：艾滋病；中医证候；基因芯片 HIV / AIDS lung and spleen deficiency syndrome transcriptome study Zhang ning （Clinical Basis of Traditional Chinese Medicine） Directed by Xie shi ping Abstract Objective: The application of mRNA chip to HIV/AIDS lung spleen-deficiency syndrome patients as research object, the controls group with Healthy people , the sample with whole blood , detection of the HIV/AIDS lung spleen-deficiency syndrome and Healthy people different genes , analyses of its function, signal pathway and the mutual relations, to find the correlation with syndrome. Through the integration of gene expression information, discusses the related function of mRNA molecule, constructing HIV/AIDS lung spleen-deficiency syndrome molecular network. Methods: The case of HIV/AIDS lung spleen-deficiency syndrome patients from Henan Province,the healthy controls from the same area, Application capitalbio DNA chips , using BRB-ArrayTools ( Version 4.1) software for a variety of gene chip data processing, scr