hiv1蛋白酶与抑制剂相互作用的理论分析-theoretical analysis of interaction between hiv - 1 protease and inhibitor.docx

下载文档 降价啦

4
0
约8.53万字
约 101页
2018-05-29 发布于上海
举报
版权申诉
保障服务

hiv1蛋白酶与抑制剂相互作用的理论分析-theoretical analysis of interaction between hiv - 1 protease and inhibitor.docx

1、本文档共101页，可阅读全部内容。
2、原创力文档（book118）网站文档一经付费（服务费），不意味着购买了该文档的版权，仅供个人/单位学习、研究之用，不得用于商业用途，未经授权，严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等，侵权必究。
3、本站所有内容均由合作方或网友上传，本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺！文档内容仅供研究参考，付费前请自行鉴别。如您付费，意味着您自己接受本站规则且自行承担风险，本站不退款、不进行额外附加服务；查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档，您可以点击这里二次下载。
4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等，请点击“版权申诉”（推荐），也可以打举报电话：400-050-0827(电话支持时间：9:00-18:30)。

hiv1蛋白酶与抑制剂相互作用的理论分析-theoretical analysis of interaction between hiv - 1 protease and inhibitor

目录中文摘要..........................................................................................................................................IAbstract.........................................................................................................................................Ⅳ第一章HIV-1蛋白酶(PR)与抑制剂(PIs)的相互作用概述1HIV-111.1.1HIV-1形态与结构21.1.2HIV-1的生命周期3HIV-1PR5PR的结构5PR的功能6PR的作用机制酶的作用机制...............................................................................................PR的作用机制8PIs9PIs的种类91.3.1PIs的功能111.4PR与PIs的相互作用111.4.1库仑形式的静电相互作用..................................................................................121.4.2范德华相互作用..................................................................................................121.4.3氢键相互作用......................................................................................................131.4.4疏水相互作用......................................................................................................13第二章理论与方法.....................................................................................................................152.1量子化学计算......................................................................................................152.1.1从头算法.....................................................................................................粒子坐标的初始化..........................................................................2.1重新加氢.................................................................................30.2加入中和离子.........................................................................30.3选择溶剂模型.........................................................................30.4进行能量优化.........................................................................30粒子速度的初始化..........................................................................312.3.4SHAKE算法312.4结合自由能计算..................................................................................................32FEP算法33TI算法34LIE算法34MM-PBSA方法352.5PIs和残基的相