大菱鲆干扰素调节因子2(irf2)的全长cdna克隆与三种mrna拼接变异体的组织分布分析-full - length cdna cloning of turbot interferon regulatory factor 2 ( irf 2 ) and tissue distribution analysis of three mrna splicing variants.docxVIP

I I 大菱鲆干扰素调节因子 2(IRF2)的全长 cDNA 克隆与三种 mRNA 拼接变异体的组织分布研究 摘要 大菱鲆(Scophthalmus maximus)原产于欧洲，自引进我国后已经成为我国北方 重要的海水养殖鱼类品种，其英文名为 turbot。近年来，大菱鲆病毒性疾病的泛 滥给我国大菱鲆的养殖业带来了直接的经济损失。因此，对大菱鲆干扰素系统的 深入研究具有重要的理论和现实意义。目前，大菱鲆 IRF2(SmIRF2)尚未被克隆 和研究。 本文采用逆转录-聚合酶链式反应（RT-PCR）、同源 PCR 克隆(Homology PCR Cloning)和 cDNA 末端快速扩增(Rapid Amplification of cDNA ends, RACE)技术， 从大菱鲆组织中获得 IRF2 基因的全长 cDNA 序列及基因组序列。研究发现大菱 鲆 IRF2 基因有三种 mRNA 拼接变异体，且它们的 5’非翻译区相同。三种 mRNA 拼接变异体的长度分别为 1807bp、1678bp 和 1506bp，且在第三种 mRNA 拼接 变异体中发现了微卫星序列。大菱鲆 IRF2 基因组 DNA 全长 11891bp，包含 10 个外显子，9 个内含子。大菱鲆 IRF2 由于存在 mRNA 拼接变异体，可以编码 2 类蛋白质，通过与其他脊椎动物的 IRF2 氨基酸序列进行多重比对，