十二份三系杂交稻亲本指纹图谱构建与应用.docVIP

十二份三系杂交稻亲本指纹图谱构建与应用 　　摘要：选取分布于水稻１２条染色体上的１１２对ＳＳＲ引物对１２份杂交稻亲本进行多态性分析，检测出３５对多态性引物。选取其中２５对多态性好的引物构建了１２份杂交稻亲本的指纹图谱。利用特异引物分别对万优２号和Ｋ优８８的杂交种进行纯度鉴定，结果表明，分子标记纯度鉴定与田间鉴定结果差异不明显。 　　关键词：杂交稻；指纹图谱；纯度鉴定 　　中图分类号：Ｑ７８９文献标识码：Ａ文章编号：0439－８114（２０11）10－2122-03 　　 　　Construction and Application of Fingerprinting Map of 12 Ternary Hybrid Rice Parents based on SSR Marker 　　 　　ＨＵ Ｊｉｎｇ－ｔａｏ，ＨＵＡＮＧ Ｗｅｎ－ｚｈａｎｇ，ＹＡＮ Ｍｉｎｇ－ｊｉａｎ，ＨＵＡＮＧ Ｃｈｅｎｇ－ｚｈｉ，ＬＥＩ Ｓｈｕ－ｆａｎ，Ｌ?? Ｚｈｉ－ｗｅｎ 　　（Ｃｈｏｎｇｑｉｎｇ Ｔｈｒｅｅ Ｇｏｒｇｅｓ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ， Ｗａｎｚｈｏｕ ４０４１５５， Ｃｈｏｎｇｑｉｎｇ， Ｃｈｉｎａ） 　　 　　Ａｂｓｔｒａｃｔ： Ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｎ １２ ｔｅｒｎａｒｙ ｈｙｂｒｉｄ ｒｉｃｅ ｐａｒｅｎｔｓ ｗｅｒｅ ｔａｋｅｎ ｂｙ ｃｈｏｏｓｉｎｇ １１２ ｐａｉｒｓ ｏｆ ＳＳＲ ｐｒｉｍｅｒｓ ｆｒｏｍ １２ ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｓ ｏｆ ｒｉｃｅ； and ３５ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃ ｐｒｉｍｅｒ ｐａｉｒｓ ｗｅｒｅ ｄｅｔｅｃｔｅｄ ａｔ ｌａｓｔ． ２５ ｐａｉｒｓ ｏｆ ＳＳＲ ｐｒｉｍｅｒｓ ｗｈｉｃｈ ｓｈｏｗｅｄ ｈｉｇｈｅｒ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ ｗｅｒｅ ｕｓｅｄ ｔｏ ｃｏｎｓｔｒｕｃｔ ｔｈｅ ｆｉｎｇｅｒｐｒｉｎｔｉｎｇ ｍａｐｓ ｏｆ ｔｈｅ １２ ｔｅｒｎａｒｙ ｈｙｂｒｉｄ ｒｉｃｅ ｐａｒｅｎｔｓ． Ｔｈｅ ｐａｒｔｉｃｕｌａｒ ｐｒｉｍｅｒｓ ｗｅｒｅ ｕｓｅｄ ｔｏ ｉｄｅｎｔｉｆｙ ｔｈｅ ｓｅｅｄ ｐｕｒｉｔｙ ｏｆ Ｗａｎｙｏｕ－２ ａｎｄ Ｋｙｏｕ－８８． Ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔｓ ｓｈｏｗｅｄ ｔｈａｔ ｔｈｅｒｅ ｗａｓ ｎｏ ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔ ｄｉｆｆｅｒｅｎｃｅ ｂｅｔｗｅｅｎ ｔｈｅ result of ＳＳＲ ｔｅｓｔ ａｎｄ ｆｉｅｌｄ ｔｅｓｔ． 　　Ｋｅｙ ｗｏｒｄｓ： ｈｙｂｒｉｄ ｒｉｃｅ； ｆｉｎｇｅｒｐｒｉｎｔｉｎｇ ｍａｐ； ｐｕｒｉｔｙ ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ 　　 　　ＤＮＡ指纹反映同种生物体中的个体差异，由于个体ＤＮＡ序列信息具有相对的稳定性，因此可结合现代分子生物学方法构建指纹图谱。在水稻研究中，指纹图谱可用于杂交稻种子的真伪及纯度鉴定，避免田间鉴定的繁琐工作，同时为品种或材料申请专利保护提供分子水平的依据。 　　ＳＳＲ作为基因组研究中的一种主要分子标记技术，在水稻中，已经广泛应用于遗传多样性分析、品种鉴定及遗传图谱构建等研究。李云海等［１］利用ＳＳＲ标记分析了生产上常用的杂交稻亲本，结果表明，生产中主要应用的水稻雄性不育系遗传背景较为单一。郭慧等［２］利用ＳＳＲ标记分析了２４份水稻雄性不育系的遗传多样性，结果表明，四川及其他省（区）使用的细胞质雄性不育系之间的遗传基础较窄。姜树坤等［３］利用ＳＳＲ标记对辽宁省大面积种植的１４个主栽品种进行了遗传多样性分析，结果表明，多数品种的亲缘关系较近，多样性不够丰富。李进波等［４］利用ＳＳＲ标记对两系杂交稻两优培胜的种子纯度进行了鉴定，结果与田间种植鉴定的结果完全吻合。曾大力等［５］对湖北省某公证处封存的２份杂交稻材料进行了真假鉴定，结果显示２份材料的微卫星指纹差异明显。肖小余等［６］利用ＳＳＲ标记对四川省主推杂交稻品种进行了指纹图谱构建及品种鉴定，从指纹数据库中筛选出了用于Ｄ优５２７纯度及真伪鉴定的特异引物。詹天才［７］利用ＳＳＲ标记对杂交稻种子进行了纯度鉴定，用两对多态性引物分别对掺假的威优４６和金优２０７两个品种分别进行纯度鉴定，结果发现两者都能有效地将掺入组合中的假种子区分开。彭锁堂等［８］利用ＳＳＲ引物构建了９个杂交稻组合亲本的指纹图谱，组合纯度鉴定表明分子标记纯度鉴定与田间种植鉴定结果无显著差异。 　　研究选取分布于水稻１２条染色体上的ＳＳＲ引物１１２对，对重庆市常用杂交稻亲本进行多态性分析，并构建指纹图谱，以期为杂交稻品种的真伪及纯度鉴定等提供分子水平的依据。 　　１材料与方法 　　１．１材料 　　杂交稻亲本共１２份，包括６份不育系（中九Ａ、Ｋ１８Ａ、协青早Ａ、金２