第3章基因组学、蛋白组学.pptxVIP

基因（Gene）的概念;染色体组（Chromosome set ）;基因组（Genome）;基因组学（Genomics）;第一节;原核生物的生命活动;一、原核生物基因组一般特征;（一）原核生物的类核结构;原核基因组类核结构;（二）原核生物的操纵子结构;（三）原核生物的结构基因;（四）具有编码同功酶的基因;二、质粒;（一）质粒的结构及理化性质;（二）质粒的命名与分类;复制机制;（三）质粒的生物学特性;;三、可移动的DNA序列;（一）插入序列;（二）转座子;（三）可转座的噬菌体;（四）转座子的遗传效应;第二节;病毒的生物学特性;一、病毒基因组特征;一、病毒基因组特征;病毒基因组结构;二、几种典型的病毒基因组;SV40病毒转录后加工;二、几种典型的病毒基因组;二、几种典型的病毒基因组;HBV DNA复制周期;二、几种典型的病毒基因组;HIV复制过程;二、几种典型的病毒基因组;第三节;一、真核基因组一般特征;真核生物基因结构;（一）单顺反子结构;（二）断裂基因;内含子与外显子;（三）重复序列;高度重复序列;反向重复序列;反向重复序列;串联重复序列;卫星DNA;卫星DNA;高度重复序列的主要功能功能;中度重复序列;低度重复序列;（四）基因家族;核苷酸序列相同，如tRNA基因。基因家族成员成簇分布在一条染色体上，同时发挥作用。 核苷酸序列高度同源，如珠蛋白基因家族。可散在地分布于不同的染色体上，编码一组功能相关的蛋白质。 编码的蛋白质高度同源，但核苷酸序列不同，如src癌基因家族。其产物均有250个氨基酸序列的同源蛋白激酶结构域。 ; 是由一组多基因家族及单基因家族组成的更大的基因家族。它们的结构有程度不同的同源性，但起源于相同的祖先基因。如免疫球蛋白基因超家族。; 在多基因家族中，某些与正常功能基因在核苷酸序列上相似，但不能转录或转录后生成物功能基因产物的DNA序列称为假基因。用ψ表示。 假基因原来也是有功能的基因，由于发生缺失、倒位、点突变等，成为无功能基因。可能为进化的痕迹。;（五）端粒;（六）DNA多态性;限制性片段长度多态性（restriction fragment length  polymorphism，RFLP）;短串联重复序列（short tandem repeat, STR）;STR与疾病的关系;单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）;二、核外基因组特征;线粒体基因组的遗传特性;第四节;一、人类基因组的特点;甲基化;二、人类基因组计划;（一）人类基因组计划的启动;遗传图谱;遗传标志;物理图谱;序列图谱;（三）功能基因组计划;转录图谱;后基因组时代研究热点;系统生物学;生物信息学;第四章 蛋白质组与蛋白组学;DNA;蛋白质组（proteome）; 蛋白质组 protein + genome proteome 一种基因组所表达的全部蛋白质 一个细胞或一个机体的基因所表达的全部蛋白质;蛋白质组与基因组的差别;蛋白质组学（proteomics）;功能蛋白质组学（ functional proteomics）;蛋白组学研究的意义;蛋白组学研究的特点;蛋白组学研究的内容;蛋白质组及其质点的分离与纯化;蛋白质组学研究技术路线;;第一节;一、蛋白质分离纯化的一般程序;（一）蛋白质样品的制备;LCM技术;（二）盐析法;（三）电泳技术;（四）层析技术;;原理：利用生物大分子具有与其结构相对应的分子（酶-底物、抗原-抗体、配体-受体、生物素-亲和素等）发生可逆性特异结合的特性达到专一的分离。 固定相：结合有亲和物的不溶于水的固相支持物 流动相：含有与亲和物匹配的待分离物缓冲液。先用流动相洗去杂质，再用特殊流动相解离待分离蛋白。;第二节;（一）Western印迹杂交;（二）双向凝胶电泳（two-dimensional gel electrophoresis，2-DE）;双向电泳原理;2-DE 技术原理;等电聚焦凝胶电泳（isoelectric focusing gel electrophoresis，IEF）;固相pH梯度等电聚焦（immobilized pH gradients isoelectric focusing,IPG-IEF）;SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳; 2-DE分析的基本步骤;双向电泳的样品制备;第一向等电聚焦电泳;第二向SDS凝胶电泳;蛋白质染色;考马斯亮蓝染色;银染色;银染色显示蛋白斑点;2-DE的不足;（三）非凝胶分离技术;（四）图像分析技术 (Image analysis);2-DE图像分析软件包操作过程：;图像采集;背景