中国鹿类动物线粒体12S+rRNA基因序列的比较分析及分子系统发育研究.pdf

摘 要 本论文应用线粒体12SrRNA基因全序列对中国鹿类动物的系统发育进行研究。 实验共计完成中国鹿类14个物种21个个体的12SrRNA基因测序，获得16个单倍 索到的獐、麂、水鹿、牛、马、羊、鼷鹿的12SrRNA基因全序列一起，通过应用分 子系统学理论与模型分析序列数据，以及对12SrRNA二级结构的分析，得出了以下 rRNA基因的全序列构 主要结论：(1)用最小进化方法(ME)和邻接法(NJ)对12S 建分子系统树的拓扑结构基本相同。(2)鹿科种内距离小于l％(0．1％-0．42％)； 美洲鹿亚科转入獐亚科，并为其中的一个独立的属(狍属)。(4)黑麝与马麝的12S rRNA基因序列完全相同，12SrRNA基因数据不支持黑麝与马麝为两个种。(5)本实 验结果支持麝作为上科的分类阶元存在。(6)12SrRNA基因的碱基代换中转换数远 远大于颠换数(2-20倍)(7)12SrRNA基因二级结构中．全序列核苷酸的碱基组成 组成相类似。(8)环区的所有核苷酸碱基代换率为茎区的2．24倍，转换率几乎相同 RNA 基因的二级结构模型。(10)i000万年内12SrRNA基因的平均进化速率为(0．3418 ％±0．0390％)／位点·MY。 12S 关键词：中国鹿类动物 rRNA基因系统发育碱基代换 进化速率 Abstract aresearchon ofChinesedeerbased Thisdissertation molecular presents phylogeny total2tindivaduls on mitochondrial12SrRNA of complete genesequences．Specimens deerwere 16 wereconfirmed 14 ofChinese haplotypes by species sequenced，and among data submittedtotheGenBank Numbers： analysis，then database．(Accession withother fuU12SrfINA of AYl84425．AYl several 84440)．Combined sequences Water and retrievedfrom Chinese deer,cow,horse，goattragulus deer,Montijac，Water setof wasutilizedfordownstream GenBartk whole database，the sequences analysis basedontheoriesandmodelsinM