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哺乳动物转录因子及其靶基因的挖掘分析 摘要 转录因子是转录调控中的核心功能蛋白，能够与顺式调控元件相结合并对下 游基因的表达进行严格调控，在生命有机体的许多重要生化过程中发挥着不可或 缺的关键性作用。鉴于转录因子在转录调控中的重要意义，转录因子及其下游调 控靶基因的识别成为后基因组时代的研究热点之一． 传统工作中，生物学家主要通过实验生物学方法来识别转录因子及其下游靶 基因。实验生物学方法能够获得比较准确的数据，但其实验周期较长，因而无法 在短时间内提供丰富的转录调控数据。近年来，生物学家开始引入计算生物学方 法来加速转录调控领域的研究进程，主要工作集中在转录因子的识别和顺式调控 元件模型的构建上。在转录因子的识别工作中，生物学家主要通过机器学习算法 来构建转录因子的识别工具．目前已建立基于BLAST算法和最近邻算法的转录 因子识别方法，但这些方法在哺乳动物中的应用不是十分理想。在顺式调控元件 的相关工作中，生物学家尝试使用各种指标来建立模型，表征转录因子与顺式调 控元件的识别偏好性，但二者的结合规律比较复杂，目前仍然处在探索过程中。 。 ‘ 本