加工番茄抗黄萎病基因的qtl定位及品种系遗传多样性分析-qtl mapping of verticillium wilt resistance gene in processed tomato and analysis of its genetic diversity.docxVIP
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加工番茄抗黄萎病基因的qtl定位及品种系遗传多样性分析-qtl mapping of verticillium wilt resistance gene in processed tomato and analysis of its genetic diversity
摘要目的:番茄黄萎病是世界番茄生产中重大病害之一,利用SSR标记构建番茄遗传连锁图谱,并对黄萎病抗性进行初步QTL定位,为建立分子标记辅助育种体系奠定基础,从而全面推进番茄抗病育种的进程。种质资源的遗传多样性是育种工作的基础,利用SSR标记对新疆主栽以及美国引进的加工番茄品种进行遗传多样性分析,旨在为新疆加工番茄的新品种选育提供理论依据。方法:以抗病品系石红303-M.和感病品系石红303-F杂交产生的184个F2:3家系为作图群体,采用SSR分子标记技术,利用Joinmap3.0和MapQTL5.0软件构建了一张加工番茄遗传连锁图谱,对加工番茄黄萎病抗性基因进行了初步QTL定位分析。利用SSR标记对48个番茄品种进行遗传多样性分析,通过NTSYS-pcVersion2.0软件计算遗传相似系数及完成遗传聚类。结果及结论:21.通过对F2:3家系抗性性状进行统计分析,结果符合抗:感植株比例为3:1的X适合性测验,说明黄萎病抗性的遗传方式是受一对基因控制的质量性状。2. 从500对SSR引物中筛选到了39对有多态的引物,用这些引物对F2群体进行分析,最后得到一张含39个位点,6个连锁群的图谱,连锁群的标记数最少2个,最多26个,覆盖总长217.2cM,标记间平均距离为5.57cM的番茄品种内分子标记遗传连锁图。3. 用复合区间作图法对抗病性状进行QTL定位,共检测到了3个QTLs,命名为Qve1,Qve3, Qve5解释的表型变异分别为16.7%、28.9%、31.6%。Qve1覆盖区域在16.35cM-24.66cM 之间,与左右引物SSR1、SSR226距离分别为1cM、2.24cM,Qve3覆盖区域在9cM-16cM 之间,与左右引物TOM144、TC167949距离分别为9cM、1.33cM,Qve5覆盖区域在17cM-29cM 之间,与左右引物SSR19、TC155130距离分别为17cM、7.34 cM。4. 48个供试品种间的遗传相似系数变化范围为0.575~0.986,平均值为0.809。且90.1% 的供试品种的遗传相似系数在0.735~0.935之间,遗传相似系数在0.900以上的占10.45%,遗传相似系数最大值达到了0.986,说明品种间遗传基础太近。5. 遗传相似系数在0.80处,可以把48份供试加工番茄品种划分为6大类。第一大类包括31品种,第二、三、五、六类都只包括一个品种。第四大类包括13个品种。结合系谱分析结果表明,新疆的加工番茄品种遗传多样不够丰富,多数品种间的亲缘关系较近. 关键词:黄萎病,SSR ,QTL ,遗传多样性AbstractObject:Verticilliumwiltisaworldwidedestructivetomatodisease,SSRmolecularmarkersareused forconstructinggeneticlinkagemapandthequalitytraitoftomatoresistancetoVerticilliumwiltlocated,setupMolecularMarker-assistedSelection(MAS),which will comprehensively promotetheprocessofresistancebreedingintomato.Thegeneticdiversityofgermplasmresourcesisthebasisforbreeding.UsingSSRmarker analyzedgeneticdiversityoftomatovarieties,whichwerebredbyXinjiangProvinceorintroduced from Ameican ,thegoalofthisisprovidingatheoreticalbasisforbreedingnewvarieties.Methods: Basedon184 F2:3 family lines fromcross betweenSH303-M(resistanttoVerticillum)×SH303-F(unresistant to Verticillum), a combined SSR genetic map of tomato has beenconstructedandaninitialQTLmappingoftomatohasbeenperformed.UsingSSRmarkerforgeneticdiversityto48tomatovarieties,byNTSYS-pcVersion2.0 softwaretocalculategeneticsimilaritycofficientsandco
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