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- 2018-06-07 发布于贵州
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代谢反应网络中的数据包络剖析
摘要
成功的生物技术的应用,如氨基酸的生产,已经诫明了在生物反应
过程中,出于耨豫经漤控裁缝擒窝酶承平蕊基函骖正两取褥了重要进步。
然而,新陈代谢路径的话学计擞复杂性使得有必要采蠲缩构纯的动态模
型来揩导实验性的应用。
室佬系统理论孛蒗震莛寒鹃孓系绫表达式在褒辩鞭基其宥竣整特
征,已经成功地用于生化系统的描述,它是用含指数形式的非线性模型
来描述生化系统的,具凑三个吸91人的特征。
艇是为褥裂零昧袋优薅蕊瓣络获态,颓不瓤改变酶蔚承平及调节结
系统模型熬基礁上孳l入含有整鼗0-1变攫熬约窳,搀戏潺台整数线蓬筑
捌阔惩(MILP),混合整数线骸瓶翔蔺题(MILP)涵藏了多种不同酶承
平和调节结构的情况,因此避免了s.系统模型的频繁求解。
然懑写|入耨赫终寒螽,攘受交褥雯复杂,蒋鬟线戆斌麓方法隶簿,
难度很大。因此,我们考虑在两次求解混合整数线性规划模型厢,采用
数据包络分析(DEA)模型来分析这鼹个结果的摆对有效性,则艟更有
效遣褥照最谯鳞。
本文在广泛查阅蹋内外文献的基础上,对DEA理沦、方法与应用
进雩亍了较深入孵撩讨,分褥了基零DEA模型,DEA有效性理论以及DEA
方法麓基本惑懋。在势褥MILP模垄求解箍栗的基确上,本文建立了评
价相对有效性的数据包络分析模型(DEA)来分析代谢反应网络。然后
耨蔫DEA煮数酌决繁攀元授影瓣挺辩鸯效垂,改进其惫簸性;避一步谯
化代谢网络结构,提商嶷成物浓度。
关键谢新陈代谢反应网络优化代谢阏络结构的DEA模型有效决策单元
ABSTRACT
Successful asaminoacid
biotechnologicatapplications,such production,have
demonstrated in bygenetic
performance
improvementbioprocess
significant
controlarchitecturesand levels.
metabolic
of
modifica£ions expression
enzyme
stoichiometricofmetabolic withtheir
however,the complexity pathways,along
ofstructured
natureand theuse
nonlinear regulatorycoupling,necessitates
strongly
in
direct andaid
kineticmodelsto experimentalapplications
ofcellular
bioprocesses,
The withinblochemicai
theory03sn
representationdeveloped systems
S.system
the
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