代谢反应网络中的数据包络剖析.pdfVIP

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  • 2018-06-07 发布于贵州
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代谢反应网络中的数据包络剖析

摘要 成功的生物技术的应用,如氨基酸的生产,已经诫明了在生物反应 过程中,出于耨豫经漤控裁缝擒窝酶承平蕊基函骖正两取褥了重要进步。 然而,新陈代谢路径的话学计擞复杂性使得有必要采蠲缩构纯的动态模 型来揩导实验性的应用。 室佬系统理论孛蒗震莛寒鹃孓系绫表达式在褒辩鞭基其宥竣整特 征,已经成功地用于生化系统的描述,它是用含指数形式的非线性模型 来描述生化系统的,具凑三个吸91人的特征。 艇是为褥裂零昧袋优薅蕊瓣络获态,颓不瓤改变酶蔚承平及调节结 系统模型熬基礁上孳l入含有整鼗0-1变攫熬约窳,搀戏潺台整数线蓬筑 捌阔惩(MILP),混合整数线骸瓶翔蔺题(MILP)涵藏了多种不同酶承 平和调节结构的情况,因此避免了s.系统模型的频繁求解。 然懑写|入耨赫终寒螽,攘受交褥雯复杂,蒋鬟线戆斌麓方法隶簿, 难度很大。因此,我们考虑在两次求解混合整数线性规划模型厢,采用 数据包络分析(DEA)模型来分析这鼹个结果的摆对有效性,则艟更有 效遣褥照最谯鳞。 本文在广泛查阅蹋内外文献的基础上,对DEA理沦、方法与应用 进雩亍了较深入孵撩讨,分褥了基零DEA模型,DEA有效性理论以及DEA 方法麓基本惑懋。在势褥MILP模垄求解箍栗的基确上,本文建立了评 价相对有效性的数据包络分析模型(DEA)来分析代谢反应网络。然后 耨蔫DEA煮数酌决繁攀元授影瓣挺辩鸯效垂,改进其惫簸性;避一步谯 化代谢网络结构,提商嶷成物浓度。 关键谢新陈代谢反应网络优化代谢阏络结构的DEA模型有效决策单元 ABSTRACT Successful asaminoacid biotechnologicatapplications,such production,have demonstrated in bygenetic performance improvementbioprocess significant controlarchitecturesand levels. metabolic of modifica£ions expression enzyme stoichiometricofmetabolic withtheir however,the complexity pathways,along ofstructured natureand theuse nonlinear regulatorycoupling,necessitates strongly in direct andaid kineticmodelsto experimentalapplications ofcellular bioprocesses, The withinblochemicai theory03sn representationdeveloped systems S.system the

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