原核表达调控PPT.ppt

6 转录水平上的其他调控方式 ;6.1 σ因子的调节作用;1. 原核生物RNA聚合酶;σ 亚基（σ factor ）的功能是帮助核心酶识别启动子，它不是RNA链延伸必需的。 σ能提高RNA聚合酶与特异启动子的亲和力，也能降低与非特异启动子的亲和力。 新生RNA链达到6-9个核苷酸，形成稳定的酶-DNA-RNA复合物时，σ因子释放。 Theσ factor 通过降低核心酶与非特异序列的亲和力,和增加其与启动子的亲和力来帮助核心酶识别启动子。 无σ factor 的核心酶也能在DNA模板上合成RNA，但不能正确地起始转录。 ;E.coli有不同的σ factor 分别转录不同类型的基因。这在基因表达调控中起重要作用。;6.1.2 枯草杆菌的孢子形成过程中的级联调控;;芽孢形成过程中的σ因子激活级联;σG激活晚期芽孢形成基因的转录;抗σ因子与抗抗σ因子;6.1.3 热激蛋白的表达;热激蛋白的表达调控主要发生在转录水平上。热激蛋白基因的启动子被σ32而不??通常的σ70识别。σ32也不能识别σ70启动子，因为这两种σ因子识别的启动子序列不一样;HSP的诱导合成是由于细胞内的σ32水平瞬间升高引起的。 在热激条件下，σ32的合成会增加，热激诱导σ32合成发生在翻译水平。 另一方面，在热激条件下σ32的稳定性也增加了。;;6.2 组蛋白类似蛋白的调节作用;6.3 转录调控因子的作用;6.4 抗终止作用;?噬菌体是以E.coli为宿主的温和病毒。它一旦感染细菌就会以2种方式繁殖。 ①溶源途径：?噬菌体感染E.coli后，将其基因组整合到细菌染色体上，随着细菌染色体的复制而复制。整合有噬菌体基因组的细菌称为溶源菌，这一过程称为溶源途径。 ②溶菌途径：?噬菌体感染宿主后也可以利用细菌细胞内的养料进行繁殖，最终使宿主裂解而死亡，这一过程称为溶菌途径。溶菌途径需要噬菌体DNA的复制和病毒外壳蛋白的形成。;λ噬菌体裂解周期中的级联调控依赖于抗终止作用 ; 溶源性细菌在正常情况下非常稳定；但在细菌受某些外界物理或化学因素(如紫外线、丝裂霉素C等)的作用，就会有效的转向溶菌途径。原噬菌体便脱离细菌染色体而进行自主复制，于是细菌裂解，游离出大量的噬菌体，这一过程称为溶源性诱导。 对繁殖途径的选择依赖于细胞对2种选择性基因表达程序的选择。 ;;Bacteriophage Lambda;;;;;;7. 转录后调控;7.1 mRNA自身结构元件对翻译起始的调控;7.2 mRNA稳定性对转录水平的影响;7.3 调节蛋白的调控作用;阻抑蛋白;7.4 反义RNA的调节作用;7.4.1 反义RNA的作用;7.4.2 反义RNA的作用机制;7.4.3 人工合成构建反义RNA;;Regulation of target RNAs by OxyS and DsrA. The left box shows a schematics of inhibition mechanisms of OxyS and the right box inhibition by DsrA. ;7.5 microRNA分子能够调节翻译;;;;7.6 稀有密码子对翻译的影响; 许多调控蛋白在细胞内含量很低，编码这些蛋白的基因中高频率地使用了很多稀有密码子，稀有密码子对应次要（低丰度）的tRNA。因此，翻译速度受tRNA供应的限制，影响了蛋白质合成的总量。 而其它基因中利用这些稀有密码子频率很低。;;7.7 重叠基因对翻译的影响;glaT的终止密码子与K的起始密码子相隔3个核苷酸，但K基因的SD序列却位于T基因的终止密码子之前。当T翻译终止时，核糖体覆盖了SD序列和K基因的起始密码子，还没有脱落就开始了K的翻译。;7.8 翻译的阻遏;细菌在葡萄糖缺乏时可产生报警物质cAMP；可保证其利用其它糖类，如lac（乳糖）操纵子、gal （半乳糖）操纵子和ara （阿拉伯糖）操纵子等。 细菌在饥饿条件下，缺乏各种氨基酸使得蛋白质合成受阻，将采取关闭大量的代谢过程来抵御不良条件，保存自己的一种机制。 当氨基酸缺乏时， tRNA成为空载体，就触发ATP和GTP合成一种新化合物，称为四磷酸鸟苷ppGpp和pppGpp。在层析谱上检出这两种化合物的斑点，称为魔斑。 GTP+ATP → pppGpp+AMP→ppGpp;;空转反应：AA饥饿时，无负载的tRNA进入核糖体的A位后，新肽键不能形成，但GTP不断消耗 空转反应导致信号分子的产生 ppGpp pppGpp ;ppGpp的主要作用可能是影响RNA pol与启动子结合的专一性，从而成为细胞内严紧控制的关键。 ppGpp也可抑制核糖体和其它大分子的合成，活化某些氨基酸操纵子的转录表