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大分子的弹性杆模子、珠簧模子及其数值模拟
摘要
DNA等大分子的研究是近年来生物力学的一个重要课题。其巾,利用弹性杆
模型和珠簧模型研究大分了的结构和运动是两利·重要方法。由于大分_了长链在长度
上具有宏观的结构特征,而纳米级的直径又具有微观性质,上世纪九十年代以来,
人们把弹件力学的方法、Brownian动力学的基木理论和分了生物学的知识结合在一
起,利用多尺度的方法对大分了的建模、数值模拟和动力学分析等进行了研究,并
取得了许多有意义的成果。
本文在宏观上研究了弹性杆的构型空间,SMK方程以时间为离散变量的Lax对
Hookean哑铃的动力学方程以及数值模拟。具体工作为:
(1)在宏观尺度上,基于弹性杆动力学方程和连续弹性杆模型,研究了SMK
方程以时间为离散变量的Lax对称结构,并导出了Kirchhoff弹性杆的半离散形式的
动力学方程。
化为Ito随机微分方程,然后运用Euler法在不同的参数下进行数值模拟,最后对两
类模型作了分析和比较。
关键词:动力学,弹性杆,对称,哑铃模型,数值模拟
Abstract
which
isan inbiomechanics
The ofDNAmacromolecule
dynamics importantsubject
and two
hasdrawnattentioninrecent rod are important
great years.Elasicbead·spring
for its moleculeshave
modelsanalyzingdynamicalproperties.Sincelong—chain
Macro.structuralcharacteristicsin andnanoscaleindiametershave
length microscopic
indifferentfieldssuchas and
knowledges elasticity,Browniandynamics
nature,many
and
arecombinedto its simulation
molecule dynamical
biology studymodeling,numerical
havebeenmade
progresses recently.
analysis,andsignificant
for
Inthis ofelasticrodisstudied.TheLax SMK
paper,theconfigurationspace pair
modeland
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