巴氏杆菌和奈瑟氏球菌中的DNA uptake旌旗灯号序列的进化研究.pdfVIP

摘要 作为生物的主要类群之一，细菌是大自然界中生物种群数量最多的一类。目 前，许多研究发现细菌的营养方式有自养和异养。而在大量细菌中，几乎所有的 细菌有一种自然的能力，为了适应周围的环境，就从环境中摄取其他细菌的DNA 序列，吸收到自己的基因组中成为自身基因组的一部分，这就是所谓的基因横向 转移。 基因发生横向转移很可能与物种的进化有关，许多细菌为了适应周围的环境 而从周围环境中摄取有利于自身发展的基因，以达到自身的有利生存。在细菌中， DNA序列时，在它们的基因组中总有一个信号序列，我们把这样的信号序列就 叫做DUSS(DNA uptakesignaJ 度为9的短串5‘一AAGTGCGGT一3’序列。 本文基于对两类细菌中DUSS的统计分析，探究DUSS在两类细菌进化中的 意义。我们的兴趣主要是DUSS在基因组中的分布特征，如DUSS在完全基因 组中的位点分布，以及分别在编码区域和非编码区域的分布。主要研究编码区域 中的阅读框的相位偏好以及非编码区域的发夹结构。基于在两类细菌中对DUSS 的分析，在其他细菌完全基因组中寻找DUSS．1ike序列片断，进而了解DUSS 在物种进化中的意义。 文章的最后部分，基于对DNA