miRNA$lncRNA(mirna 和lncrna 的简介)PPT.pptx

MicroRNA;简介;特点;加工成熟;Drosha-DGCR8复合体;Argonaute 蛋白 (AGO）;作用原理;作用结果;MiRNA 功能;;相关数据库;TargetScan 基于靶mRNA序列的进化保守等特征搜寻动物的microRNA靶基因。是预测microRNA靶标假阳性率较低的软件。; ;;;lncRNA;简介;特性;分类;作用机制;生物学功能;;; 目前发现的参与哺乳动物基因活动的lnc RNA已有上千个,其调控基因表达的机制存在共性。 一般来说,lnc RNA主要从3个层面实现对基因表达的调控。;一、表观遗传调控 ;;1 . 基因组印记 ; DNA 甲基化参与基因印记的建立和维持, 它发生在生殖细胞的印记控制区 (ICR ) 。 目前对这一领域的研究基本上是针对两个基因印记区: 17号染色体近端的IGF2受体(Igf2r)区和7号染色体远端的Kcnq1区, lncRNA 在这些印记位点发挥重要作用。LncRNA 在印记区介导等位基因沉默。; 目前已知的是,高达半数的哺乳动物基因都能转录,而其中大部分转录产物是非编码RNA(包括lncRNA),已有个别lncRNA被证明参与调控印记基因表达。 小鼠17号染色体的Igf2r区是第一个被证实的可转录为lncRNA的位点。;1. X 染色体失活; Xist(X inactive specific transcript)介导的X染色体失活的特征总结来说就是丧失激活性的组蛋白修饰(如乙酰化)而获得抑制性的组蛋白修饰(如H3K27的三甲基化),导致失活染色体上的许多CpG岛启动子甲基化,失活的染色体依旧持续合成Xist,以维持本身的失活状态。 但有活性的X染色体如何阻止XistRNA的结合机制还不明确。; 另有研究报道:X染色体失活尚存在另一机制,即与一种调控性小非编码RNA有关。Xist和反义链转录本Tsix退火复性后可形成一RNA二聚体, 在Dicer酶作用下,被加工剪切成约24-42nt大小的调控性siRNA,这一机制对于失活的X染色体上的抑制性异染色质的修饰是必需的,因为X染色体失活过程中组蛋白、赖氨酸和三甲基色氨酸等都需要这些siRNA,并且X染色体激活时X ist启动子区的CpG岛甲基化也需要它们。; 以上机制或许可以推测lncRNA和RNA在染色质重塑方面的作用与联系,同时提示RNA调控存在着一个更为复杂的、交互的网络。;二、转录调控 ;1.LncRNA 的转录可以干扰邻近基因的表达;2.LncRNA可作为共因子调节转录因子的活性;2018/3/5 星期一;人类疾病相关lncRNA;相关数据库;;;NONCODE：提供对长链非编码RNA的全面注释，包括表达和该团队开发的ncFANs计算机软件预测的lncRNA功能。这是非编码RNA研究的知名数据库，已经更新到第三版。 NRED： 提供人和小鼠的长链非编码RNA在芯片数据的表达信息。这也是John mattick实验室构建的网站。