王镜岩生物化学讲义 1蛋白质2PPT.ppt

Mb的构象与功能的关系(Mb结合氧的的定量分析) Hb的构象与功能的关系 Hb的构象与功能的关系 Hb的构象与功能的关系 Hb的构象与功能的关系 Hb的构象与功能的关系 Hb的构象与功能的关系 Hb的构象与功能的关系 Hb的构象与功能的关系 Hb的构象与功能的关系 Hb的构象与功能的关系 Hb的构象与功能的关系 不同BPG浓度对Hb氧和曲线的影响 Mb 和 Hb功能的异同： 1.Mb只有输氧，Hb除了输氧外还有运输 H+ 和CO2的功能 2.Hb是一个至今了解的最清楚的别构蛋白, 具有正协同性 3.Hb中的氧合曲线呈“S”型，Mb呈双曲线 4.H+ 、CO2 起到缓冲血液pH的作用 (组织呼吸释放的CO2进入红细胞中生成H+ HCO2-,补偿由于组织呼吸形成CO2引起的pH降低.增加H+浓度（降低pH）将提高O2从血红蛋白中释放) 4.BPG 、H+ 、CO2 是Hb的别构抑制剂 血红蛋白与分子病 血红蛋白与分子病 血红蛋白与分子病 血红蛋白与分子病 免疫系统与免疫球蛋白 免疫系统与免疫球蛋白 免疫系统与免疫球蛋白 免疫系统与免疫球蛋白 免疫系统与免疫球蛋白 免疫系统与免疫球蛋白 免疫系统与免疫球蛋白 免疫系统与免疫球蛋白 免疫系统与免疫球蛋白 免疫系统与免疫球蛋白 ? －转角（回折）：肽链180°旋转，氢键连接； 无规则卷曲 ?—转角 卵溶菌酶 无规则卷曲 三、超二级结构：概念：相邻二级结构单元 相互作用形成的聚合体 D E 种类：??（A） ?X?(B、C) ?曲折（D） 回形拓扑结构(E) 四、结构域：概念：蛋白质分子中在空间相对独立的三维实体。 乳酸脱氢酶结构域 刀豆蛋白结构域 弹性蛋白酶三级结构与结构域 免疫球蛋白G 例：肌红蛋白。是肌肉中运输氧的蛋白质，一条肽链，153个氨基酸残基，分子量为16700，含一个血红素辅基，氧分子就结合在它的铁上。整个分子有8个?-螺旋，并且有?-转角和无规则卷曲，但是无?-折叠 。 又如：卵溶菌酶 五、三级结构：定义：蛋白质分子中所有原子的空间排列 特点： ① 高低不平 IgG的结构 ②疏密不一 ③近似球状 醛糖脱氢酶 ③ 外亲内疏 如：血红蛋白含有四个亚基，为?2?2，每个亚基含一个血红素，每个血红素可结合一个氧分子。?亚基含141个氨基酸残基，?亚基含146个氨基酸残基。 亚基与肽链的区别，亚基 是指寡聚蛋白中非共价连接的亚单位，它可以是一条肽链，也可以是通过共价键连接起来的几条肽链。 亚基和原体 原体是指寡聚蛋白中等同的结构成分，有时原体就是一个亚基，但有时是几个亚基。如血红蛋白的亚基数为四个，但其原体数为二个。 ?-亚基 ?-亚基 ? -亚基 ? -亚基 血红素 血红素 Fe2+ Fe2+ Hemoglobin空间结构 六、四级结构：概念：蛋白质分子中亚基在空间的排列 氢键、盐键、疏水作用力、二硫键、配位键、范德华引力 氢键 盐键 疏水作用力 二硫键 配位键 范德华引力 二级结构 √ × × × × √ 三级结构 √ √ √ √ √ √ 四级结构 √ √ √ × × √ 七、维持蛋白质空间结构的作用力 一、蛋白质的变性 二、氨基酸序列规定蛋白质的三维结构 　　　-----一级结构与空间结构的关系 三、蛋白质结构预测 蛋白质折叠与结构预测 蛋白质结构和功能预测??? DNA序列的测序速度,远远超过测定蛋白质三维结构的进展。因此,如何从蛋白质序列甚至由DNA读框翻译出的氨基酸序列预测可能的蛋白质结构,就成为迫切的任务。目前较为有效的预测方法,都要依靠已知三维结构的蛋白质的序列来预测折叠单元。基于轮廓(profile)的预测方法,通常假定两段被比较的蛋白质序列的氨基酸残基接近水环境的情形是保守的。另一种所谓“线串法”(threading)则同时考虑单个残基的环境和一定距离内双残基的相互作用,因而效果较好。 二级结构及三级结构预测通常采用/tools/中的Molecular modeling and visualization tools,VMD或Swiss-PdbViewer进行 BTI的同源性比对 预测的 BTI 二级结构 预测的 BTI 三级结构 一、蛋白质的功能：催化、运转、运动、能量交换、免疫、激素、调节、结构、贮存 二、一级结构与功能的关系：一级结构与功能有密切的关系 P181-189 1. 氨基酸对功能的重要性 如果改变的氨基酸是蛋白质执行功能所必需的，则这种氨基酸的改变对功能的影响极大，如果改变的氨基酸对功能无贡献，则它们