GCBI课堂第二季1-大豆对乳腺癌的基因表达.pptVIP

大豆对乳腺癌基因表达的影响 随机对照组临床试验分析 试验设计 第一目标： 大豆粉组和安慰剂组比较肿瘤细胞增殖指标、凋亡指标； 第二目标： 检测基因表达谱芯片、定量PCR、NanoString表达检测 设计方案 设计方案 特别说明：免疫组化检测内容 HER2 ER Ki67：标记肿瘤细胞增殖能力 Cas3：标记肿瘤细胞凋亡能力 IHC评分：10倍光镜下Ki67和Cas3的染色比例 特别说明：Nanostring检测 可以同时检测202个自定义基因的表达量 批量基因检测的成本低于定量PCR 为绝对基因表达定量 比基因芯片具有极高的灵敏度，可用来检测极低丰度的mRNA，若每个细胞只表达单个mRNA也能够被检测出来 特别说明：PAM50 50个基因，可以从表达层面对乳腺癌分型 比较(非基因芯片分析) 基因芯片比较 结论 大豆服用组的血浆异黄酮含量是安慰剂组的4-7倍 使用Nanostring检测已知的乳腺癌相关基因，FANCC、UGT2A1服用大豆粉后增加，而安慰剂组减少 全基因芯片检测后发现，高血浆异黄酮组增加了癌细胞增殖类基因的表达 使用PAM50基因对样本分群后发现，高血浆异黄酮组的分型类似于Luminal B型样本，低血浆异黄酮组的分型类似于Luminal A型样本 FGFR2在服用大豆粉组明显表达增加 无论是否服用大豆粉，不会影响增殖类和凋亡类的病理变化 文中尚未挖掘之处 指标： 是否绝经 服用大豆粉还是安慰剂 病理分型 ER分型 血浆异黄酮分型 * * * 谎言终结者 GCBI CEO 李奇 2003年硕士毕业于复旦大学医学院 参与生物信息研发12年 微信 QQ 有文章说 亚洲人群 吃大豆可以降低乳腺癌发病风险？ 大豆主要含量是雌激素类的异黄酮，包括两类： 大豆甙元(Daidzein) 染料木素 每多吃10mg异黄酮，乳腺癌风险降低16% 欧洲人群，无效！ 异黄酮 雌激素受体 刺激 雌激素敏感的乳腺癌细胞增殖 抑制乳腺癌细胞增殖 ? 随机入组病人 140例 大豆 70 例 安慰剂 70 例 双盲法分配病例 病人 132例 失访8例 28例未获得组织样本 1 血浆异黄酮检测125例 大豆组63例，安慰剂组62例 1 免疫组织化学检测 132-28=104例 大豆组54例，安慰剂组50例 1 Nanostring检测 14例 大豆组8例，安慰剂组6例 活检穿刺样本 大豆粉服用7-30天 安慰剂(奶粉)服用7-30天 外科手术取样 2 血浆异黄酮检测125例 大豆组63例，安慰剂组62例 2 免疫组织化学检测 132-28=104例 大豆组54例，安慰剂组50例 2 基因表达谱芯片检测 51例 大豆组28例，安慰剂组23例 2 Nanostring检测 14例 大豆组8例，安慰剂组6例 病人服用大豆粉/安慰剂前 病人服用大豆粉/安慰剂后 血浆异黄酮、Ki67、Cas3 服用大豆粉组 服用安慰剂组比较 血浆异黄酮、Ki67、 Cas3、 Nanostring、 定量PCR 基因表达谱芯片 比较一 比较二 血浆异黄酮浓度，服用大豆粉组呈现明显差异 大豆组 安慰剂组 服用大豆粉/安慰剂前后 表达相反的基因 服用大豆粉组 服用安慰剂组 高血浆异黄酮组 低血浆异黄酮组 差异比较一 差异比较二 差异基因分析 聚类分析 信号通路分析 功能分析 基因相互作用网络分析 基于PAM50的分子分型 查看服用大豆粉的样本 与 现有乳腺癌的哪种分型更类似 * *