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第二章--蛋白质的结构和功能

血红蛋白的四级结构 从一级结构到四级结构 商洛职业技术学院 第二节 蛋白质的分子结构 The Molecular Structure of Protein 蛋白质是由许多氨基酸单位通过肽键连接形成的具有特定分子结构的高分子化合物。 蛋白质的分子结构可分为一级、二级、三级和四级。一级结构是蛋白质的基本结构,二级、三级、四级结构称为高级或空间构象。 一、蛋白质的一级结构 (primary structure) 概念 是指蛋白质分子中氨基酸的排列顺序。 主要的化学键 肽键、有些蛋白质还含有二硫键。 胰岛素(Insulin)世界上第一个被确定一级结构的蛋白质。 人胰岛素的一级结构 一级结构是决定蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础,但不是决定蛋白质空间构象唯一因素。 测定蛋白质的一级结构的主要意义 一级结构是研究高级结构的基础。 可以从分子水平阐明蛋白质的结构与功能的关系。 可以为人工合成蛋白质提供参考顺序。 二、蛋白质的空间结构 空间结构 指蛋白质分子内各原子围绕某些共价键的旋转而形成的各种空间排布及相互关系,称为蛋白质的构象。 蛋白质的构象分为主链构象和侧链构象。 (一)蛋白质的二级结构 (secondary structure) 概念 是指蛋白质多肽链主链原子局部的空间排列,不涉及氨基酸残基侧链的构象。 维系蛋白质二级结构的主要化学键是氢键。 1.形成二级结构的基础 肽键(C-N)键长为0.132nm C-N单键长为0.149nm C=N双键长为0.127nm 肽键有一定程度双键性能,不能自由旋转,有顺反异构现象。 肽键平面(肽单元 peptide unit) 形成肽键的C-N键具有部分双键的性质,使得形成的酰胺键的四个原子及相邻的Cα处于同一平面上叫酰胺平面或肽键平面。它是蛋白质构象的基本结构单位。 肽键平面 2.蛋白质二级结构的主要形式 α-螺旋 β-折叠 β-转角 无规卷曲 (1)α-螺旋 (?-helix) ——最常见 α-螺旋的结构特点 ①多肽链以肽键平面为单位,α-碳原子为转折点,有规律的盘绕成右手螺旋结构。 ②每3.6个氨基酸残基盘绕一圈,螺距为0.54nm。 ③相邻螺旋的肽键之间形成氢键,方向与长轴基本平行,维持螺旋的稳定。 ④R基团伸向螺旋外侧,其大小、形状及电荷性质均影响α-螺旋的形成。 (2)β-折叠(β-pleated sheet) β-折叠的结构特点 ①多肽链呈伸展状态,肽键平面沿长轴折叠呈锯齿状,两平面间夹角为110°,R基交替地伸向锯齿状结构的上下方。 ②若干肽段互相靠拢,平行排列,通过氢键连接。氢键的方向与长轴垂直。 ③若两条肽段走向一致(N端、C端方向相同),称为顺向平行;反之,称之为逆向平行,逆向更稳定。 (3)β-转角(β-turn) β-转角的特点 ①主链骨架本身以大约180°回折 ②回折部分通常由4个氨基酸残基构成 ③构象依靠第一残基的-CO基与第四残基的- NH基之间形成氢键来维系。 (4)无规卷曲(nonregular coil) 是指多肽链中除了以上几种比较规则的构象外,其余没有确定规律性的那部分肽链构象。 (二)蛋白质的三级结构 (tertiary structure) 概念 是指整条肽链中所有原子的空间排布,它包括主链构象和侧链构象。 主要化学键 疏水键、氢键、盐键等非共价键和二硫键。 疏水键是维持三级结构稳定的最主要作用力。 超二级结构(supersecondary structure) 超二级结构是指若干相邻的二级结构中的构象单元彼此相互作用,形成有规则的,在空间上能辨认的二级结构组合体。通常有βαβ,βββ,αα,ββ 。 βαβ αα ββ 结构域(domain) 是在超二级结构基础上进一步卷曲折叠成紧密的近似球状的结构,在空间上彼此分隔,各自具有部分生物功能的结构。 由一条多肽链形成的蛋白质,其最高级结构为三级结构。只有具有三级结构的蛋白质才具有生物学活性。 结构域(domain) 小的蛋白质分子只有一个结构域,大的蛋白质分子有数个结构域 √结构域=三级结构 蛋白质的三级结构 蛋白质的三

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